Zoonotic significance of Escherichia coli strains isolated from cattle and pigs

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F18%3AN0000030" target="_blank" >RIV/00027162:_____/18:N0000030 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/62157124:16270/18:43877123

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Zoonotický význam kmenů Escherichia coli izolovaných ze skotu a prasat

Original language description

Cíl práce: Cílem této studie bylo sledovat vlastnosti Shiga toxin produkujících kmenů Escherichia coli (STEC) získaných od zvířat s ohledem na příslušnost k séroskupině, typ a subtyp Shiga toxinu a adherenčí faktor intimin. Na základě výsledků vyhodnotit výskyt jednotlivých subtypů Shiga toxinů a možný význam kmenů pro humánní populaci. Materiál a metody: Do studie bylo zařazeno 131 kmenů STEC, které pocházely z rektálních výtěrů skotu (80) a prasat (51) odebraných na farmách České republiky v letech 2000 - 2017. Vybrané kmeny se lišily původem a příslušností k somatickému antigenu. Metodou PCR byla ověřena přítomnost Shiga toxinů, intiminu a stanoveny subtypy Shiga toxinů stx1a, stx1c, stx1d, stx2a, stx2b, stx2c, stx2d, stx2e, stx2g. Výsledky: Gen stx1 byl potvrzen u 33 % kmenů (43/131), gen stx2 u 55 % (72/131) a 16 kmenů neslo geny pro oba toxiny současně (12 %). Kmenů se schopností tvořit intimin bylo detekováno 46 (35 %), většinou v rektálních výtěrech skotu. Kmeny ze skotu náležely k 21 různým séroskupinám. Převažoval u nich výskyt Shiga toxinu 1 (55, 69 %) se subtypy stx1a (54) a stx1d (1). Shiga toxin 2 byl potvrzen u 39 kmenů (49 %). Detekovány byly tyto varianty stx2a (9), stx2e (6) a stx2g (3), stx2a, stx2c (5), stx2a, stx2b (1) a stx2c, stx2d (1). Dále byla zjištěna kombinace stx1a, stx2a (12) a stx1a, stx2c (2). Většina z těchto kmenů (44; 55 %) nesla současně i gen eae. Kmeny z prasat náležely k 5 séroskupinám. Dominantně byl prokázán Shiga toxin 2 (49; 96 %) a subtypy stx2e (42), stx2a (7). Shiga toxin 1 byl detekován u 4 kmenů, a to subtyp stx1a (1), stx1c (1) a v kombinaci stx1a, stx2a (2). Pouze u 2 kmenů byl prokázán i gen eae. Závěr: Kmeny STEC izolované ze skotu náležely k většímu spektru séroskupin, byly častěji vybaveny adherenčním faktorem intiminem a byly vybaveny více variantami Shiga toxinů, včetně těch prokazatelně spojených se závažným onemocněním lidí, než kmeny z prasat. V souboru izolátů z prasat prevaloval gen stx2e, jehož význam pro člověka nebyl zcela objasněn.

Czech name

Zoonotický význam kmenů Escherichia coli izolovaných ze skotu a prasat

Czech description

Cíl práce: Cílem této studie bylo sledovat vlastnosti Shiga toxin produkujících kmenů Escherichia coli (STEC) získaných od zvířat s ohledem na příslušnost k séroskupině, typ a subtyp Shiga toxinu a adherenčí faktor intimin. Na základě výsledků vyhodnotit výskyt jednotlivých subtypů Shiga toxinů a možný význam kmenů pro humánní populaci. Materiál a metody: Do studie bylo zařazeno 131 kmenů STEC, které pocházely z rektálních výtěrů skotu (80) a prasat (51) odebraných na farmách České republiky v letech 2000 - 2017. Vybrané kmeny se lišily původem a příslušností k somatickému antigenu. Metodou PCR byla ověřena přítomnost Shiga toxinů, intiminu a stanoveny subtypy Shiga toxinů stx1a, stx1c, stx1d, stx2a, stx2b, stx2c, stx2d, stx2e, stx2g. Výsledky: Gen stx1 byl potvrzen u 33 % kmenů (43/131), gen stx2 u 55 % (72/131) a 16 kmenů neslo geny pro oba toxiny současně (12 %). Kmenů se schopností tvořit intimin bylo detekováno 46 (35 %), většinou v rektálních výtěrech skotu. Kmeny ze skotu náležely k 21 různým séroskupinám. Převažoval u nich výskyt Shiga toxinu 1 (55, 69 %) se subtypy stx1a (54) a stx1d (1). Shiga toxin 2 byl potvrzen u 39 kmenů (49 %). Detekovány byly tyto varianty stx2a (9), stx2e (6) a stx2g (3), stx2a, stx2c (5), stx2a, stx2b (1) a stx2c, stx2d (1). Dále byla zjištěna kombinace stx1a, stx2a (12) a stx1a, stx2c (2). Většina z těchto kmenů (44; 55 %) nesla současně i gen eae. Kmeny z prasat náležely k 5 séroskupinám. Dominantně byl prokázán Shiga toxin 2 (49; 96 %) a subtypy stx2e (42), stx2a (7). Shiga toxin 1 byl detekován u 4 kmenů, a to subtyp stx1a (1), stx1c (1) a v kombinaci stx1a, stx2a (2). Pouze u 2 kmenů byl prokázán i gen eae. Závěr: Kmeny STEC izolované ze skotu náležely k většímu spektru séroskupin, byly častěji vybaveny adherenčním faktorem intiminem a byly vybaveny více variantami Shiga toxinů, včetně těch prokazatelně spojených se závažným onemocněním lidí, než kmeny z prasat. V souboru izolátů z prasat prevaloval gen stx2e, jehož význam pro člověka nebyl zcela objasněn.

Type

J_SC - Article in a specialist periodical, which is included in the SCOPUS database

CEP classification

—

OECD FORD branch

10606 - Microbiology

Project

<a href="/en/project/LO1218" target="_blank" >LO1218: Healthy animal as a source of wholesome food</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Publication year

2018

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Klinická mikrobiologie a infekční lékařství

ISSN

1211-264X

e-ISSN

—

Volume of the periodical

24

Issue of the periodical within the volume

2

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

5

Pages from-to

36-40

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

2-s2.0-85061381882