All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Construction and stability testing of the reference standard for the detection and quantification of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis in faeces by qPCR

The result's identifiers

  • Result code in IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F19%3AN0000260" target="_blank" >RIV/00027162:_____/19:N0000260 - isvavai.cz</a>

  • Alternative codes found

    RIV/00027162:_____/19:N0000322

  • Result on the web

    <a href="http://www.rank.cz/files/sbornik-RANK-2019.pdf" target="_blank" >http://www.rank.cz/files/sbornik-RANK-2019.pdf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternative languages

  • Result language

    čeština

  • Original language name

    Konstrukce a testování stability referenčního standardu pro detekci a kvantifikaci Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis v trusu metodou qPCR

  • Original language description

    15. ročník konference RANK 2019, 6. a 7. února 2019 v prostorách hotelu Zlatá Štika v Pardubicích – poster. Kvantitativní PCR (qPCR) v dnešní době představuje jednu z nejvíce využívaných přímých metod detekce a kvantifikace Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP). Množství MAP stanovené pomocí qPCR však závisí na typu použitého kvantifikačního standardu qPCR (plazmid, izolovaná DNA), což v praxi může vést k situaci, kdy není možné navzájem porovnat výsledky stanovené různými testy qPCR v různých laboratořích. Vytvoření referenčního standardu by mělo přinést sjednocení kvantifikačních standardů při detekci MAP a umožnit porovnávání kvantitativních dat mezi různými laboratořemi. Cílem této studie bylo vytvořit prototyp referenčního standardu pro kvantifikaci MAP v trusu metodou qPCR, nalézt vhodnou matrici pro uchovávání a otestovat stabilitu a reprodukovatelnost v průběhu času. S ohledem na stabilitu, uchovávání a případnou přepravu byla jako nejvhodnější forma standardu zvolena lyofilizovaná suspenze trusu, která byla uměle kontaminována referenčním kmenem MAP. Celkem bylo použito pět typů lyofilizačních matric a ve čtrnáctidenních intervalech byl sledován jejich vliv na stabilitu MAP. Z lyofilizovaného standardu byla izolována DNA pomocí standardizovaného protokolu a následně byla provedena kvantifikace MAP metodou qPCR. Byla vybrána nejvhodnější lyofilizační matrice, která bude následně testována při různých skladovacích podmínkách.

  • Czech name

    Konstrukce a testování stability referenčního standardu pro detekci a kvantifikaci Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis v trusu metodou qPCR

  • Czech description

    15. ročník konference RANK 2019, 6. a 7. února 2019 v prostorách hotelu Zlatá Štika v Pardubicích – poster. Kvantitativní PCR (qPCR) v dnešní době představuje jednu z nejvíce využívaných přímých metod detekce a kvantifikace Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP). Množství MAP stanovené pomocí qPCR však závisí na typu použitého kvantifikačního standardu qPCR (plazmid, izolovaná DNA), což v praxi může vést k situaci, kdy není možné navzájem porovnat výsledky stanovené různými testy qPCR v různých laboratořích. Vytvoření referenčního standardu by mělo přinést sjednocení kvantifikačních standardů při detekci MAP a umožnit porovnávání kvantitativních dat mezi různými laboratořemi. Cílem této studie bylo vytvořit prototyp referenčního standardu pro kvantifikaci MAP v trusu metodou qPCR, nalézt vhodnou matrici pro uchovávání a otestovat stabilitu a reprodukovatelnost v průběhu času. S ohledem na stabilitu, uchovávání a případnou přepravu byla jako nejvhodnější forma standardu zvolena lyofilizovaná suspenze trusu, která byla uměle kontaminována referenčním kmenem MAP. Celkem bylo použito pět typů lyofilizačních matric a ve čtrnáctidenních intervalech byl sledován jejich vliv na stabilitu MAP. Z lyofilizovaného standardu byla izolována DNA pomocí standardizovaného protokolu a následně byla provedena kvantifikace MAP metodou qPCR. Byla vybrána nejvhodnější lyofilizační matrice, která bude následně testována při různých skladovacích podmínkách.

Classification

  • Type

    O - Miscellaneous

  • CEP classification

  • OECD FORD branch

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Result continuities

  • Project

    <a href="/en/project/VI20152020044" target="_blank" >VI20152020044: Multiplex xMAP technology for a complex detection of pathogenic agents significant for the protection of human and animal health</a><br>

  • Continuities

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Others

  • Publication year

    2019

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů