PCR-RFLP method for resolution Streptococcus suis serotypes 2 and 1/2 and serotypes 1 and 14
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F20%3AN0000154" target="_blank" >RIV/00027162:_____/20:N0000154 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://www.vri.cz/wp-content/uploads/2021/01/VUVeL-Certifikovana_metodika-123-Matiasovic-Metoda_PCR-RFLP_pro_rozl_serotypu_12Streptococcus_suis_od_serotypu_2_a_serotypu_1_od_serotypu_14-final.pdf" target="_blank" >https://www.vri.cz/wp-content/uploads/2021/01/VUVeL-Certifikovana_metodika-123-Matiasovic-Metoda_PCR-RFLP_pro_rozl_serotypu_12Streptococcus_suis_od_serotypu_2_a_serotypu_1_od_serotypu_14-final.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Metoda PCR-RFLP pro rozlišení sérotypu 1/2 Streptococcus suis od sérotypu 2 a sérotypu 1 od sérotypu 14
Original language description
Metodika popisuje postup použitelný k odlišení sérotypu 1/2 od sérotypu 2 a sérotypu 1 od sérotypu 14 Streptococcus suis. Předpokládá předchozí identifikaci nerozlišených sérotypů 1/2, 2 a 1, 14 od ostatních sérotypů Streptococcus suis například multiplexní PCR reakcí (Liu et al. 2013; Kerdsin et al. 2014, Okura et al. 2014) nebo aglutinační reakcí. Metoda je založena na end-point polymerázové řetězové reakci, následném štěpení PCR produktu restrikční endonukleázou BstNI (PCR-RFLP) a vizualizaci produktů štěpení v agarózovém gelu.
Czech name
Metoda PCR-RFLP pro rozlišení sérotypu 1/2 Streptococcus suis od sérotypu 2 a sérotypu 1 od sérotypu 14
Czech description
Metodika popisuje postup použitelný k odlišení sérotypu 1/2 od sérotypu 2 a sérotypu 1 od sérotypu 14 Streptococcus suis. Předpokládá předchozí identifikaci nerozlišených sérotypů 1/2, 2 a 1, 14 od ostatních sérotypů Streptococcus suis například multiplexní PCR reakcí (Liu et al. 2013; Kerdsin et al. 2014, Okura et al. 2014) nebo aglutinační reakcí. Metoda je založena na end-point polymerázové řetězové reakci, následném štěpení PCR produktu restrikční endonukleázou BstNI (PCR-RFLP) a vizualizaci produktů štěpení v agarózovém gelu.
Classification
Type
N<sub>metC</sub> - Methodology certified by the authorised body
CEP classification
—
OECD FORD branch
10606 - Microbiology
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK1810193" target="_blank" >QK1810193: Modern methods of diagnosis, therapy and prevention of Streptococcus suis infections as a tool for designing of targeted control programs in pig herds</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2020
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
123/2020
Regulation ID
68562/2020-MZE-14152
Technical parameters
Cílem uplatnění metodiky je rozlišení sérotypu 1/2 Streptococcus suis od sérotypu 2 a sérotypu 1 od sérotypu 14.
Economical parameters
Náklady na zavedení metodiky v laboratoři vybavené pro provádění PCR a gelové elektroforézy spočívají pouze v nákupu specifických reagencií, tj. primerů a restrikční endonukleázy, celkem přibližně 4000 Kč. Přímý ekonomický přínos spočívá v rozšíření služeb sérotypizace Streptococcussuis uživatelem metodiky. Nepřímý přínos spočívá v identifikaci sérotypů Streptococcus suis se zoonotickým potenciálem od ostatních sérotypů Streptococcus suis a možnosti uplatnění opatření k zabránění infekcí lidí.
Certification body designation
Státní zdravotní ústav, Šrobárova 49/48, Praha 100 00
Date of certification
—
Method of use
B - Výsledek je využíván orgány státní nebo veřejné správy