Presence of resistant genes and analyzing of its surrounding in isolates of L. amylovorus obtained from gastrointestinal tract of domestic pigs and wild boars
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F22%3AN0000104" target="_blank" >RIV/00027162:_____/22:N0000104 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://kongrescssm2022.bpp.cz/cs/odborny-program-108" target="_blank" >https://kongrescssm2022.bpp.cz/cs/odborny-program-108</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Výskyt genů rezistence a studium okolí těchto genů u izolátů L. amyovorus získaných z gastrointestinálního traktu domácích a volně žijících prasat
Original language description
Úvod: Rozvoj antibiotické rezistence v chovech prasat se stává alarmující problematikou. Hospodářským zvířatům jsou běžně podávána antibiotika při terapeutických úkonech. Právě zvířata, léčená antibiotiky, mohou být rezervoárem rezistentních bakterií pro volně žijící druhy zvířat. Cíl: Cílem této studie bylo zanalyzovat genomy testovaných izolátů L. amylovorus, odebraných z trávicího traktu domácích a divokých prasat, z hlediska výskytu genů rezistence a z hlediska šíření těchto genů. Metodika: Izoláty byly analyzovány pomocí fenotypových metod, ale také pomocí celogenomového sekvenování s využitím technologie Illumina. Pomocí specializovaných databází (ResFinder, CARD) a programů (MEGA-X, Artemis, MAUVE) byly vyhledávány geny rezistence a bylo studováno okolí těchto genů. Výsledky: Při rozboru sekvenčních dat byla zjištěna přítomnost zejména genů rezistence tetW a ermB. Přítomnost těchto genů byla prokázána u izolátů získaných z domácích prasat, které vykazovaly fenotypovou rezistenci k těmto antibiotikům. V okolí genu rezistence se vyskytovalo velké množství transposáz podmiňujících přenos daného úseku. Závěr: Bylo zjištěno, že izoláty pocházející z domácích prasat obsahují ve svém genomu geny rezistence. U divočáků bylo naopak zjištěno nízké procento rezistentních laktobacilů. Je však jen otázkou času, kdy se rezistentní bakterie dostanou i do gastrointestinálního traktu zvířat, která nejsou primárně exponována antibiotickému působení. "
Czech name
Výskyt genů rezistence a studium okolí těchto genů u izolátů L. amyovorus získaných z gastrointestinálního traktu domácích a volně žijících prasat
Czech description
—
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
—
OECD FORD branch
40201 - Animal and dairy science; (Animal biotechnology to be 4.4)
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK1910351" target="_blank" >QK1910351: Wild boar and domestic pigs as a source of probiotic cultures and the influence of technological processes of preparation and synbiotic feed composition on its effectiveness and functionality</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2022
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů