Using a Single-Capillary Bidirectional Sequencing for Genotyping the TGFB1 Gene
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00179906%3A_____%2F13%3A10173989" target="_blank" >RIV/00179906:_____/13:10173989 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/00216208:11150/13:10173989
Result on the web
<a href="http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2013_11_880-884.pdf" target="_blank" >http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2013_11_880-884.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Využití jednokapilárového obousměrného sekvenování pro genotypizaci TGF?1 genu
Original language description
Ve studii prezentujeme metodu jednokapilárové elektroforézy při verifikaci obousměrné sekvenační analýzy pro genetický polymorfismus -1552delAGG v genu TGFB1. Pro verifikaci byla použita sekvenační reakce s forward a reverzními primery modifikovanými na5'- koncích adaptery složenými z 55 (forvard primer) a 10 (reverzní primer) repeticemi cytosinu a adeninu (CA adaptéry). Ty umožnily kompletní čtení obou vláken amplikonu a definovat rozdílný migrační čas obou fragmentů při kapilární elektroforéze. Studie ukázala, že připojení CA adaptérů k primerům umožňuje provést sekvenování obou vláken amplikonu v jedné reakční zkumavce a separovat obě vlákna v jediné kapiláře.
Czech name
Využití jednokapilárového obousměrného sekvenování pro genotypizaci TGF?1 genu
Czech description
Ve studii prezentujeme metodu jednokapilárové elektroforézy při verifikaci obousměrné sekvenační analýzy pro genetický polymorfismus -1552delAGG v genu TGFB1. Pro verifikaci byla použita sekvenační reakce s forward a reverzními primery modifikovanými na5'- koncích adaptery složenými z 55 (forvard primer) a 10 (reverzní primer) repeticemi cytosinu a adeninu (CA adaptéry). Ty umožnily kompletní čtení obou vláken amplikonu a definovat rozdílný migrační čas obou fragmentů při kapilární elektroforéze. Studie ukázala, že připojení CA adaptérů k primerům umožňuje provést sekvenování obou vláken amplikonu v jedné reakční zkumavce a separovat obě vlákna v jediné kapiláře.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
CE - Biochemistry
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/NT11334" target="_blank" >NT11334: Genetic prediction of late toxicity of radiotherapy for cervical cancer</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2013
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Chemické listy
ISSN
0009-2770
e-ISSN
—
Volume of the periodical
107
Issue of the periodical within the volume
11
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
5
Pages from-to
880-884
UT code for WoS article
000328730000009
EID of the result in the Scopus database
—