Machine learning in digital pathology

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00209805%3A_____%2F25%3A00080405" target="_blank" >RIV/00209805:_____/25:00080405 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="https://www.cspatologie.cz/archiv.php?nr=102" target="_blank" >https://www.cspatologie.cz/archiv.php?nr=102</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Strojové učení v digitální patologii

Original language description

S postupující digitalizací patologie se do popředí zájmu dostávají i aplikace metod strojového učení a umělé inteligence. Výzkum a vývoj v této oblasti je velmi rychlý, ale aplikace učících systémů v klinické praxi stále zaostávají. Cílem tohoto textu je přiblížit proces tvorby a nasazení učících systémů v digitální patologii. Začneme popisem základních vlastností dat produkovaných v rámci digitální patologie. Konkrétně pojednáme o skenerech a skenování vzorků, o ukládání a přenosu dat, o kontrole jejich kvality a přípravě pro zpracování pomocí učících systémů, zejména o anotacích. Naším cílem je prezentovat aktuální přístupy k řešení technických problémů a zároveň upozornit na úskalí, na která lze narazit při zpracování dat z digitální patologie. V první části také naznačíme, jak vypadají aktuální softwarová řešení pro prohlížení naskenovaných vzorků a implementace diagnostických postupů zahrnujících učící systémy. Ve druhé části textu popíšeme obvyklé úlohy digitální patologie a naznačíme obvyklé přístupy k jejich řešení. V této části zejména vysvětlíme, jak je nutné modifikovat standardní metody strojového učení pro zpracování velkých skenů a pojednáme o konkrétních aplikacích v diagnostice. Na závěr textu poskytneme rychlý náhled dalšího možného vývoje učících systémů v digitální patologii. Zejména ilustrujeme podstatu přechodu na velké základní modely a naznačíme problematiku virtuálního barvení vzorků. Doufáme, že tento text přispěje k lepší orientaci v rapidně se vyvíjející oblasti strojového učení v digitální patologii a tím přispěje k rychlejší adopci učících metod v této oblasti.

Czech name

Strojové učení v digitální patologii

Czech description

S postupující digitalizací patologie se do popředí zájmu dostávají i aplikace metod strojového učení a umělé inteligence. Výzkum a vývoj v této oblasti je velmi rychlý, ale aplikace učících systémů v klinické praxi stále zaostávají. Cílem tohoto textu je přiblížit proces tvorby a nasazení učících systémů v digitální patologii. Začneme popisem základních vlastností dat produkovaných v rámci digitální patologie. Konkrétně pojednáme o skenerech a skenování vzorků, o ukládání a přenosu dat, o kontrole jejich kvality a přípravě pro zpracování pomocí učících systémů, zejména o anotacích. Naším cílem je prezentovat aktuální přístupy k řešení technických problémů a zároveň upozornit na úskalí, na která lze narazit při zpracování dat z digitální patologie. V první části také naznačíme, jak vypadají aktuální softwarová řešení pro prohlížení naskenovaných vzorků a implementace diagnostických postupů zahrnujících učící systémy. Ve druhé části textu popíšeme obvyklé úlohy digitální patologie a naznačíme obvyklé přístupy k jejich řešení. V této části zejména vysvětlíme, jak je nutné modifikovat standardní metody strojového učení pro zpracování velkých skenů a pojednáme o konkrétních aplikacích v diagnostice. Na závěr textu poskytneme rychlý náhled dalšího možného vývoje učících systémů v digitální patologii. Zejména ilustrujeme podstatu přechodu na velké základní modely a naznačíme problematiku virtuálního barvení vzorků. Doufáme, že tento text přispěje k lepší orientaci v rapidně se vyvíjející oblasti strojového učení v digitální patologii a tím přispěje k rychlejší adopci učících metod v této oblasti.

Type

J_SC - Article in a specialist periodical, which is included in the SCOPUS database

CEP classification

—

OECD FORD branch

30109 - Pathology

Project

—

Continuities

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Publication year

2025

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Česko-slovenská patologie a soudní lékařství

ISSN

1210-7875

e-ISSN

1805-4498

Volume of the periodical

61

Issue of the periodical within the volume

2

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

12

Pages from-to

58-69

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

2-s2.0-105013076679