Identification of an optimal algorithm for effective diagnostics of non-small cell lung cancer with ALK gene rearrangement - implementation of the method and practical experiences with routine diagnostics

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F17%3A10366532" target="_blank" >RIV/00216208:11110/17:10366532 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/00216208:11150/17:10366532 RIV/00179906:_____/17:10366532 RIV/00064190:_____/17:N0000125 RIV/00064165:_____/17:10366532

Result on the web

<a href="http://www.cspatologie.cz/docs/881-fulltext.pdf" target="_blank" >http://www.cspatologie.cz/docs/881-fulltext.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Stanovení optimálního vyšetřovacího algoritmu pro efektivní vyhledávání nemalobuněčných karcinomů plic s přestavbou genu ALK - zavedení metodiky a praktické zkušenosti z rutinního vyšetřování

Original language description

Cílem retrospektivní (RS) části studie bylo a) nalezení imunohistochemického (IHC) postupu detekce proteinu ALK, který bude mít dostatečnou senzitivitu a specificitu, aby jej bylo možné použít jako screeningové metody při vybírání případů nemalobuněčného karcinomu plic (NSCLC) pro následné testování přestavby genu ALK metodou fluorescenční in situ hybridizace (FISH) a b) zjištění diagnostické výtěžnosti endo- a trans- bronchiálních a transtorakálních biopsií a cytobloků pro vyšetření přestavby genu ALK. Takto zjištěná optimální IHC metodika detekce exprese ALK proteinu (klon D5F3, Cell Signaling Technology, Danvers, MA, USA) byla následně ověřena v prospektivním (PS) rutinním vyšetřování pacientů s NSCLC. ALK status byl korelován s morfologickým vzhledem tumorů a s vybranými klinickými údaji. V RS části bylo IHC a FISH vyšetřeno 170 případů EGFR-nemutovaných NSCLC. V PS části studie bylo IHC vyšetřeno 557 případů a FISH 76 případů NSCLC. V RS souboru bylo nalezeno 8/154 (5,2 %) případů s přestavbou ALK, při PS vyšetřování pak 24/557 (4,3 %). Senzitivita a specificita zvolené IHC screeningové metody byly v RS části 100 % a 99 %, v PS části pak 100 % a 80 %. Diagnostická výtěžnost &quot;malých&quot; biopsií se v RS části pohybovala v závislosti na zvolené IHC variantě v rozmezí 74 - 80 %, v PS části pak činila 88 %. U žádného PS vyšetřovaného případu s pozitivní přestavbou ALK nebyla detekována mutace EGFR. Vysoká diagnostická výtěžnost vypovídá o možnosti testování ALK stavu i u &quot;malých&quot; biopsií. Prevalence 5,2 % v RS části (EGFR nemutovaných případů) a 4,3 % v PS části (bez znalosti EGFR mutace), morfologický vzhled tumorů (solidní a acinární typ, mucinózní či alespoň parciální hlenotvorba) i nižší průměrný věk a zastoupení pohlaví u pacientů s ALK pozitivními nádory v našem PS souboru (57,5 let vs. 65,2 let, 8 mužů/16 žen vs. 336 mužů/197 žen) jsou v souladu s celosvětovými údaji.

Czech name

Stanovení optimálního vyšetřovacího algoritmu pro efektivní vyhledávání nemalobuněčných karcinomů plic s přestavbou genu ALK - zavedení metodiky a praktické zkušenosti z rutinního vyšetřování

Czech description

Cílem retrospektivní (RS) části studie bylo a) nalezení imunohistochemického (IHC) postupu detekce proteinu ALK, který bude mít dostatečnou senzitivitu a specificitu, aby jej bylo možné použít jako screeningové metody při vybírání případů nemalobuněčného karcinomu plic (NSCLC) pro následné testování přestavby genu ALK metodou fluorescenční in situ hybridizace (FISH) a b) zjištění diagnostické výtěžnosti endo- a trans- bronchiálních a transtorakálních biopsií a cytobloků pro vyšetření přestavby genu ALK. Takto zjištěná optimální IHC metodika detekce exprese ALK proteinu (klon D5F3, Cell Signaling Technology, Danvers, MA, USA) byla následně ověřena v prospektivním (PS) rutinním vyšetřování pacientů s NSCLC. ALK status byl korelován s morfologickým vzhledem tumorů a s vybranými klinickými údaji. V RS části bylo IHC a FISH vyšetřeno 170 případů EGFR-nemutovaných NSCLC. V PS části studie bylo IHC vyšetřeno 557 případů a FISH 76 případů NSCLC. V RS souboru bylo nalezeno 8/154 (5,2 %) případů s přestavbou ALK, při PS vyšetřování pak 24/557 (4,3 %). Senzitivita a specificita zvolené IHC screeningové metody byly v RS části 100 % a 99 %, v PS části pak 100 % a 80 %. Diagnostická výtěžnost &quot;malých&quot; biopsií se v RS části pohybovala v závislosti na zvolené IHC variantě v rozmezí 74 - 80 %, v PS části pak činila 88 %. U žádného PS vyšetřovaného případu s pozitivní přestavbou ALK nebyla detekována mutace EGFR. Vysoká diagnostická výtěžnost vypovídá o možnosti testování ALK stavu i u &quot;malých&quot; biopsií. Prevalence 5,2 % v RS části (EGFR nemutovaných případů) a 4,3 % v PS části (bez znalosti EGFR mutace), morfologický vzhled tumorů (solidní a acinární typ, mucinózní či alespoň parciální hlenotvorba) i nižší průměrný věk a zastoupení pohlaví u pacientů s ALK pozitivními nádory v našem PS souboru (57,5 let vs. 65,2 let, 8 mužů/16 žen vs. 336 mužů/197 žen) jsou v souladu s celosvětovými údaji.

Type

J_ost - Miscellaneous article in a specialist periodical

CEP classification

—

OECD FORD branch

30109 - Pathology

Project

<a href="/en/project/LM2015089" target="_blank" >LM2015089: Bank of Clinical Specimens</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Publication year

2017

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Česko-slovenská patologie a Soudní lékařství

ISSN

1210-7875

e-ISSN

—

Volume of the periodical

53

Issue of the periodical within the volume

2

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

8

Pages from-to

89-96

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—