Discrete Fourier transform-based analysis of HeLa cell microtubules after ultrasonic exposure

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F05%3A00012839" target="_blank" >RIV/00216224:14110/05:00012839 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Discrete Fourier transform-based analysis of HeLa cell microtubules after ultrasonic exposure

Original language description

Cytoskeletal structures can be affected by ultrasound. We exposed HeLa cells to continuous ultrasound (1 MHz, 1 and 2 W.cm-2, 10 min. at 37 C). The microtubules were detected by the monoclonal antibody TU-01/SwAM/FITC, observed in a fluorescence microscope and photographed digitally. The images were processed by FFT magic software. The structure analysis is based on frequency domain filtering using discrete Fourier transform. We tried to design filters to extract information describing best the structural changes. The properties of the filter can be enhanced by direction filtering, i.e., extraction of a symmetric angular segment in the frequency domain centred on a zero frequency. The final image is a normalised sum of inverse FFTs of such segmented spectra. The method yielded the ratio of the area of microtubules to the total cell area. Assuming that the image background intensity is constant, we can use thresholding to detect areas occupied by the cells. The information about the are

Czech name

Diskrétní fourierovská analýza miktubul bunk HeLa po ultrazvukové expozici

Czech description

Cytoskeletální struktury mohou být ovlivnovany ultrazvukem. Bunky HeLa jsme vystavili spojitému ultrazvuku (1 MHz, 1-2 W.cm-2, 10 min. pri 37 C). Mikrotubuly byly detegovány monoklonální protilátkou TU-01/SwAM/FITC, pozorovány ve fluorescencním mikroskopu a digitálne fotografovány. Obrázky byla zpracovány pomocí software "FTT Magic". Strukturní analýza je založena filtrování frekvencních domén pomocí diskrétní fourierovské transformace. Pokusili jsme se vytvorit filtr pro získání informace nejlépe popisující zmeny struktury. Vlastnosti filtru mohou být zesíleny smerovým filtrováním, t.j. vyjmutím symetrického úhlového segmentu ve frekvencní oblasti centrované na nulu. Výsledný obraz je normalizovaným souctem inverzních FTT takto segmentovaných spekter.Metoda poskytla pomer plochy mikrotubulu k celkové ploše bunky. Za predpokladu konstantní úrovne intenzity pozadí, použili jsme pro urení ploch bunek prahování. Informace o ploše mikrotubulu je obsdažena v širokém spektru vyšších intenzi

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

BO - Biophysics

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GA301%2F01%2F1102" target="_blank" >GA301/01/1102: Influencing the cytoskeleton of normal and tumour cells by physical factors and substances with anti-tumour activity</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Microscopy Reasearch Technique

ISSN

1059-910X

e-ISSN

—

Volume of the periodical

68

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

5

Pages from-to

1-5

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—