Comparative genomics of pathogenic strains of T. pallidum.
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F06%3A00016080" target="_blank" >RIV/00216224:14110/06:00016080 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Komparativní genomika patogenních kmenů T. pallidum.
Original language description
Byly porovnány čtyři genomy blízce příbuzných spirochet rodu Treponema metodou DNA fingerprintingu. Byly vyšetřeny kmeny Nichols, SS14 (T. p. pallidum), Samoan D (T. p. pertenue) a Cuniculi A (T. paraluiscuniculi). T. p. pallidum je etiologickým agens sexuálně přenosné syfilis a je obligátním patogenem člověka, T. p. pertenue způsobuje nevenerické infekce a je mírně invazivní, T. paraluiscuniculi způsobuje venerické onemocnění králíků a je nepatogenní pro člověka. Lze předpokládat, že různá míra invazivity a patogenity těchto spirochet se bude odrážet v rozdílech jejich genomů. Na základě kompletní nukleotidové sekvence kmene Nichols byly genomy vybraných zástupců rozděleny do 97 překrývajících se intervalů, tyto intervaly byly amplifikovány a štěpenyrestrikčními enzymy BamH I, EcoR I a Hind III. Restrikční profily jednotlivých kmenů byly srovnány a použity k identifikaci heterologních oblastí.
Czech name
Komparativní genomika patogenních kmenů T. pallidum.
Czech description
Byly porovnány čtyři genomy blízce příbuzných spirochet rodu Treponema metodou DNA fingerprintingu. Byly vyšetřeny kmeny Nichols, SS14 (T. p. pallidum), Samoan D (T. p. pertenue) a Cuniculi A (T. paraluiscuniculi). T. p. pallidum je etiologickým agens sexuálně přenosné syfilis a je obligátním patogenem člověka, T. p. pertenue způsobuje nevenerické infekce a je mírně invazivní, T. paraluiscuniculi způsobuje venerické onemocnění králíků a je nepatogenní pro člověka. Lze předpokládat, že různá míra invazivity a patogenity těchto spirochet se bude odrážet v rozdílech jejich genomů. Na základě kompletní nukleotidové sekvence kmene Nichols byly genomy vybraných zástupců rozděleny do 97 překrývajících se intervalů, tyto intervaly byly amplifikovány a štěpenyrestrikčními enzymy BamH I, EcoR I a Hind III. Restrikční profily jednotlivých kmenů byly srovnány a použity k identifikaci heterologních oblastí.
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2006
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů