Complete genome sequence of Treponema pallidum subspecies pallidum Dallas 1

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F07%3A00019073" target="_blank" >RIV/00216224:14110/07:00019073 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
slovinština
Original language name
Určovanie genómovej sekvencie Treponema pallidum subspecies pallidum kmeňa Dallas 1
Original language description
Treponema pallidum ssp. pallidum Dallas 1 je jedným z kmeňov spôsobujúci syfilis. Tento kmeň bol izolovaný v Dallase a s kmeňom Nichols objaveným v roku 1912 vo Washingtone patria do rovnakého poddruhu. K určeniu variability kmeňov poddruhu T. p. pallidum sme sekvencovali genom kmeňa Dallas 1 pomocou pyrosekvencovania (454 Life Sciences). Táto metóda je zvlášť vhodná pre určenie kompletnej sekvencie genómov mikroorganizmov, ktoré nie sme schopní kultivovať v podmienkach in vitro. Celogenómové rozdiely medzi kmeňmi Dallas 1 a Nichols pozostávali z 85 SNP, 143 jednonukleotidových delecií a inzercií (indelov) a 4 dlhších indelov o dĺžke 2 až 4 bp. Stanovenie sekvenčných rozdielov medzi jednotlivými genomami príbuzných treponem bude použité pre určenie vnútropoddruhovej (vnútry poddruhu T. p. pallidum) a medzipoddruhovej variability (medzi poddruhami T. p. pallidum a T. p. pertenue).
Czech name
—
Czech description
—

Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year
2007
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Similar results(10)