Detection of yeast from haemocultures and artificial materials from patients in 2022
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F24%3A00137596" target="_blank" >RIV/00216224:14110/24:00137596 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://www.med.muni.cz/tomdny" target="_blank" >https://www.med.muni.cz/tomdny</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.P280-0550-2024" target="_blank" >10.5817/CZ.MUNI.P280-0550-2024</a>
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Záchyt kvasinek z hemokultur a umělých materiálů od pacientů v roce 2022
Original language description
Výzkum byl zaměřen na pacienty s diagnózou kandidémie nebo kvasinkovou kolonizací katetrů v roce 2022 vyšetřených na MIU FN u sv. Anny v Brně. Byly hodnoceny zachycené druhy kvasinek a jejich citlivost k antimykotikům. Dále jsme sledovali věk, pohlaví a diagnózy pacientů, délku hospitalizace a typ oddělení, na kterém byli pacienti uloženi. Hemokultury se kultivovaly v hemomatu DB Bactec FX 200 (Becton Dickinson, FR). Pozitivní záchyty se barvily podle Grama a dále kultivovaly na standardních kultivačních půdách. Katétry se vyšetřovaly semikvantitativně sonifikací (Sonorex Digital 10P, Bandelin, DE) s následnou kultivací na standardních médiích a Sabouraudově agaru (Milipore, DE). Kvasinky byly identifikovány orientačně pomocí selektivní chromogenní půdy CHROMagar (Trios, FR) a poté dourčeny MALDI TOF MS (Bruker Daltonics, USA). Citlivost k antimykotikům byla stanovena primárně difuzním diskovým testem (Liofilchem, IT) a E- testy (Biomérieux, FR), v klinicky závažných případech pomocí Sensititre YestOne (TermoFisher Scientific, USA). Z celkem 1327 pozitivních hemokultur bylo zachyceno 46 s kvasinkami od 19 pacientů. Nejčastěji byla identifikována C. albicans (CAAL, 11 pacientů), která vyrostla průměrně ve 2 lahvičkách. Dále jsme zachytili C. glabratu (CAGL, 5 pacientů), která rostla průměrně ve 4 lahvičkách, C. tropicalis (CATR, 3 pacienti) průměrně 3 záchyty a C. parapsilosis (CAPA, 1 pacient) se 3 záchyty. U 2 pacientů vyrostly kvasinky pouze v anaerobních lahvičkách a to 1 CAAL a 1 CAGL. Vyšší prevalence záchytu byla u pacientů hospitalizovaných na oddělení JIP a ARO a hospitalizovaných delší dobu než 21 dní. Věkový medián pacientů byl vyšší než 70 let a nebyl ovlivněn pohlavím. Kvasinkovou sepsí nejčastěji trpěli pacienti na chirurgii s postižením gastrointestinálního traktu (5 pacientů), což odpovídá i datům nadnárodní studie ECMM Candida III multinational European observational cohort study. Z celkem 1911 pozitivních záchytů kultivace katétrů bylo 33 od 30 pacientů s nárůstem kvasinek, 5 pacientů mělo pozitivní i hemokulturu. Nejčastěji byla identifikována CAAL (18 pacientů), dále jsme zachytili CAGL (5 pacientů), CAPA (4 pacienti), CATR (2 pacienti) a C. krusei (1 pacient). Nejčastější diagnózou pacientů s kvasinkovou kolonizací katétrů byla kardiovaskulární onemocnění.
Czech name
Záchyt kvasinek z hemokultur a umělých materiálů od pacientů v roce 2022
Czech description
Výzkum byl zaměřen na pacienty s diagnózou kandidémie nebo kvasinkovou kolonizací katetrů v roce 2022 vyšetřených na MIU FN u sv. Anny v Brně. Byly hodnoceny zachycené druhy kvasinek a jejich citlivost k antimykotikům. Dále jsme sledovali věk, pohlaví a diagnózy pacientů, délku hospitalizace a typ oddělení, na kterém byli pacienti uloženi. Hemokultury se kultivovaly v hemomatu DB Bactec FX 200 (Becton Dickinson, FR). Pozitivní záchyty se barvily podle Grama a dále kultivovaly na standardních kultivačních půdách. Katétry se vyšetřovaly semikvantitativně sonifikací (Sonorex Digital 10P, Bandelin, DE) s následnou kultivací na standardních médiích a Sabouraudově agaru (Milipore, DE). Kvasinky byly identifikovány orientačně pomocí selektivní chromogenní půdy CHROMagar (Trios, FR) a poté dourčeny MALDI TOF MS (Bruker Daltonics, USA). Citlivost k antimykotikům byla stanovena primárně difuzním diskovým testem (Liofilchem, IT) a E- testy (Biomérieux, FR), v klinicky závažných případech pomocí Sensititre YestOne (TermoFisher Scientific, USA). Z celkem 1327 pozitivních hemokultur bylo zachyceno 46 s kvasinkami od 19 pacientů. Nejčastěji byla identifikována C. albicans (CAAL, 11 pacientů), která vyrostla průměrně ve 2 lahvičkách. Dále jsme zachytili C. glabratu (CAGL, 5 pacientů), která rostla průměrně ve 4 lahvičkách, C. tropicalis (CATR, 3 pacienti) průměrně 3 záchyty a C. parapsilosis (CAPA, 1 pacient) se 3 záchyty. U 2 pacientů vyrostly kvasinky pouze v anaerobních lahvičkách a to 1 CAAL a 1 CAGL. Vyšší prevalence záchytu byla u pacientů hospitalizovaných na oddělení JIP a ARO a hospitalizovaných delší dobu než 21 dní. Věkový medián pacientů byl vyšší než 70 let a nebyl ovlivněn pohlavím. Kvasinkovou sepsí nejčastěji trpěli pacienti na chirurgii s postižením gastrointestinálního traktu (5 pacientů), což odpovídá i datům nadnárodní studie ECMM Candida III multinational European observational cohort study. Z celkem 1911 pozitivních záchytů kultivace katétrů bylo 33 od 30 pacientů s nárůstem kvasinek, 5 pacientů mělo pozitivní i hemokulturu. Nejčastěji byla identifikována CAAL (18 pacientů), dále jsme zachytili CAGL (5 pacientů), CAPA (4 pacienti), CATR (2 pacienti) a C. krusei (1 pacient). Nejčastější diagnózou pacientů s kvasinkovou kolonizací katétrů byla kardiovaskulární onemocnění.
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
—
OECD FORD branch
10606 - Microbiology
Result continuities
Project
—
Continuities
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Others
Publication year
2024
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů