All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Characterization of esculin-positive Pseudomonas fluorescens strains isolated from an underground brook

The result's identifiers

  • Result code in IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00019868" target="_blank" >RIV/00216224:14310/04:00019868 - isvavai.cz</a>

  • Result on the web

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternative languages

  • Result language

    angličtina

  • Original language name

    Characterization of esculin-positive Pseudomonas fluorescens strains isolated from an underground brook

  • Original language description

    A group of sixteen esculin-positive fluorescent pseudomonads isolated from an underground brook flowing through a cave complex was characterized by biotyping, multiple enzyme restriction fragment length polymorphism analysis of 16S rDNA (MERFLP), ribotyping and whole cell fatty acid methyl esters analysis (FAME). All strains were phenotypically close to Pseudomonas fluorescens, but they revealed high biochemical variability as well as some reactions atypical for P. fluorescens species. Because identification of pseudomonads by the use of biochemical testing is often unclear, further techniques were applied to this group. Fingerprints obtained by MERFLP clearly showed that all strains represent P. fluorescens species. Ribotyping separated the strains analysed into four groups corresponding almost completely (with the exception of one strain) to clustering based on biochemical profiles. FAME analysis grouped all the strains into one cluster together with the P. putida (biotype A, B), P.

  • Czech name

    Charakteristika eskulinpozitivních kmenů Pseudomonas fluorescens izolovaných z podzemního potoka

  • Czech description

    Skupina 16 eskulinpozitivních fluorescentních pseudomonád izolovaných z podzemního potoka tekoucího jeskynním systémem byla charakterizována biotypizací, restrikční analýzou genu pro 16S rRNA (MERFLP), ribotypizací a analýzou mastných kyselin (FAME). Všechny kmeny byly fenotypově blízké druhu Pseudomonas fluorescens, ale vykázaly vysokou fenotypovou variabilitu a některé reakce atypické pro druh P. fluorescens. Protože biochemická identifikace pseudomonád je často nejednoznačná byly použity další techniky. Restrikční profil získaný metodou MERFLP jasně potvrdil, že všechny kmeny reprezentují druh P. fluorescens. Ribotypizace rozdělila analyzované kmeny do čtyř skupin, které odpovídaly biochemickým výsledkům. FAME analýza seskupila všechny analyzované kmeny do jedné skupiny spolu s referenčními kmeny P. putida (biotyp A, B), P. chlororaphis a P. fluorescens biotyp F, ale separovala je od dalších FAME profilů všech pseudomonád obsažených ve standardní knihovně TSBA 40 (MIDI).

Classification

  • Type

    J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

  • CEP classification

    EE - Microbiology, virology

  • OECD FORD branch

Result continuities

  • Project

    <a href="/en/project/GP204%2F02%2FD099" target="_blank" >GP204/02/D099: Database of the ribotype profiles of bacterial type strains</a><br>

  • Continuities

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Others

  • Publication year

    2004

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data specific for result type

  • Name of the periodical

    Folia Microbiologica

  • ISSN

    0015-5632

  • e-ISSN

  • Volume of the periodical

    49

  • Issue of the periodical within the volume

    6

  • Country of publishing house

    CZ - CZECH REPUBLIC

  • Number of pages

    6

  • Pages from-to

    725-730

  • UT code for WoS article

  • EID of the result in the Scopus database