Isolation of PCR-ready DNA from Mycobacterial cells using magnetic particles

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F05%3A00012824" target="_blank" >RIV/00216224:14310/05:00012824 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Isolation of PCR-ready DNA from Mycobacterial cells using magnetic particles

Original language description

For this study, chicken erythrocyte DNA and calf liver RNA were used. For both types of nucleic acids, we compared the binding capacity of the following particles: non-magnetic particles based on silica, magnetic particles based on ferrite, and magneticparticles P(HEMA-co-GMA) microspheres covered with carboxylic groups. A binding buffer containing 8% PEG and 2M NaCl (final concentration) was shown to be the most appropriate combination for further studies. Separated DNA was eluted using TE buffer. Theknowledge acquired was used for the development of a PCR-ready mycobacterial DNA isolation technique. Mycobacterial DNA from the eluate was detected by amplification of the dnaJ gene. The primers Multidnajf and MultidnaJr amplify a product 140 bp long.The sensitivity of the reaction is 5 . 10-3 ng/ul (5.95. 10+2 copies).

Czech name

Izolace mykobakteriální DNA v kvalitě pro PCR pomocí magnetických částic

Czech description

Byly stanoveny vazebné kapacity DNA z kuřecích erythrocytů a RNA z hovězích jater na následující částice: silikagel, magnetické feritové částice a magnetické P(HEMA-co-GMA)mikročástice obsahující karboxylové skupiny. Jako nejvhodnější vazebný pufr byl zjištěn 8% PEG a 2M NaCl (konečná koncentrace). Z částic byla DNA eluována pomocí TE pufru. Získané znalosti byly využity při izolaci mykobakteriální DNA v kvalitě vhodné pro PCR. Mykobakteriální DNA byla detekována amplifikací genu dnaj. Pomocí primerů Multidnajf a MultidnaJr byl amplifikován produkt o velikosti 140 bp. Citlivost stanovení byla 5,0 x 10-3 ng/ul (5,95 x 10+2 kopií buněk).

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

EE - Microbiology, virology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GA203%2F05%2F2256" target="_blank" >GA203/05/2256: Magnetic stimuli-responsive hydrophilic polymer microspheres for biomedicine/bioengineering</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

11th International Symposium on Separation Sciences ISSS 2005

ISBN

80-7194-771-7

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

1

Pages from-to

299-299

Publisher name

Univeryita Pardubice

Place of publication

Pardubice, Česká republika

Event location

Univeryita Pardubice

Event date

Sep 12, 2005

Type of event by nationality

WRD - Celosvětová akce

UT code for WoS article

—