Paenibacillus mendelii sp. nov., a bacterium from surface-sterilized seeds of Pisum sativum L.
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F05%3A00014428" target="_blank" >RIV/00216224:14310/05:00014428 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Paenibacillus mendelii sp. nov., a bacterium from surface-sterilized seeds of Pisum sativum L.
Original language description
A Gram-variable, facultatively anaerobic, endospore-forming bacterium was isolated from surface-sterilized seeds of the garden pea and characterized with phenotypic and molecular methods. A PCR with the Paenibacillus-specific primer PAEN515F and the 16SrRNA gene sequence indicated that strain C/2T belongs to the genus Paenibacillus and is closely related to Paenibacillus phyllosphaerae (94,0 % sequence similarity). Strain C/2T generated a unique phenotypic profile, in particular for the production of acid from substrates. The DNA G+C content (50,8 mol%) and the major fatty acid (anteiso-C15 : 0) are consistent with the genus Paenibacillus. DNA-DNA hybridization distinguished strain C/2T from other phylogenetically related Paenibacillus species and, therefore, strain C/2T (=CCM 4839T=LMG 23002T) is here described as the type strain of a novel species, for which the name Paenibacillus mendelii sp. nov. is proposed.
Czech name
Paenibacillus mendelii sp. nov., bakterie izolovaná z povrchově sterilizovaných semen hrachu setého (Pisum sativum L.)
Czech description
Gram variabilní, fakultativně anaerobní bakterie tvořící endospory, byla izolována z povrchově sterilizovaných semen hrachu setého a charakterizována pomocí fenotypových a genotypových metod. PCR s primerem specifickými pro rod Paenibacillus (PAEN515F) asekvence genu 16S rRNA indikovala, že kmen C/2T náleží do rodu Paenibacillus a je blízce příbuzný druhu Paenibacillus phyllosphaerae (94,O % podobnost sekvencí). Kmen C/2T vytváří jedinečné fenotypové profily, především v produkci kyseliny ze substrátů.Obsah guaninu a cytozinu (50,8 mol%) a převažující mastná kyselina (anteiso-C15 : 0) odpovídají charakterizaci rodu Paenibacillus. DNA-DNA hybridizace odlišuje kmen C/2T od ostatních, fylogeneticky příbuzných druhů rodu Paenibacillus a proto byl kmen C/2T (=CCM 4839T=LMG 23002T) popsán jako nový druh Paenibacillus mendelii.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EE - Microbiology, virology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
—
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2005
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
ISSN
1466-5026
e-ISSN
—
Volume of the periodical
55
Issue of the periodical within the volume
6
Country of publishing house
GB - UNITED KINGDOM
Number of pages
4
Pages from-to
2351-2354
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—