Comparative analysis of Trifolium pratense and Trifolium medium repetitive elements by next-generation sequencing
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F14%3A00073261" target="_blank" >RIV/00216224:14310/14:00073261 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="http://www.biologicals.cz/conferences/index.php?conference_id=20" target="_blank" >http://www.biologicals.cz/conferences/index.php?conference_id=20</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Srovnávací analýza repetitivních sekvencí Trifolium pratense a Trifolium medium sekvenováním nové generace
Original language description
Rod Trifolium (jetel) je jedním z agronomicky důležitých rodů čeledi Fabaceae. V České republice patří mezi nejvýznamnější zástupce jetel luční (T. pratense L.), který je kvalitní pícninou poskytující vysoké výnosy. Pro překonání nízké vytrvalosti byla vnedávné době provedena úspěšná mezidruhová hybridizace tetraploidního jetele lučního odrůdy Tatra (2n = 4x = 28) s planým oktoploidním jetelem prostředním (T. medium L.; 2n = 8x = 64). U obou druhů bylo provedeno sekvenování metodou Illumina a bioinformatická analýza získaných sekvencí s cílem charakterizovat repetitivní elementy. Druhová specifita byla potvrzena celkem u 2 elementů jetele lučního a 20 elementů jetele prostředního. Uvedené repetitivní elementy byly také lokalizovány na chromozomy příslušného druhu pomocí fluorescenční in situ hybridizace (FISH).
Czech name
Srovnávací analýza repetitivních sekvencí Trifolium pratense a Trifolium medium sekvenováním nové generace
Czech description
Rod Trifolium (jetel) je jedním z agronomicky důležitých rodů čeledi Fabaceae. V České republice patří mezi nejvýznamnější zástupce jetel luční (T. pratense L.), který je kvalitní pícninou poskytující vysoké výnosy. Pro překonání nízké vytrvalosti byla vnedávné době provedena úspěšná mezidruhová hybridizace tetraploidního jetele lučního odrůdy Tatra (2n = 4x = 28) s planým oktoploidním jetelem prostředním (T. medium L.; 2n = 8x = 64). U obou druhů bylo provedeno sekvenování metodou Illumina a bioinformatická analýza získaných sekvencí s cílem charakterizovat repetitivní elementy. Druhová specifita byla potvrzena celkem u 2 elementů jetele lučního a 20 elementů jetele prostředního. Uvedené repetitivní elementy byly také lokalizovány na chromozomy příslušného druhu pomocí fluorescenční in situ hybridizace (FISH).
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QI111A019" target="_blank" >QI111A019: New genomic technology for the alogamic cultivated plant breeding for improving utility traits.</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Others
Publication year
2014
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů