Genetic structures of the Central European striped field mouse (Apodemus agrarius) populations
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F23%3A00140227" target="_blank" >RIV/00216224:14310/23:00140227 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Genetická struktura středoevropských populací myšice temnopásé (Apodemus agrarius)
Original language description
Myšice temnopásá (Apodemus agrarius) je drobný myšovitý hlodavec původem z východní Asie, odkud expandovala přes Rusko až do západní Evropy; její rozšíření tak pokrývá většinu palearktického regionu. Kolonizace střední Evropy proběhla pravděpodobně v průběhu holocénu vlivem klimatických změn, které způsobily vznik otevřenějších habitatů. Kvůli relativně nedávné expanzi nevykazují evropské populace myšice temnopásé výraznou genetickou variabilitu (mtDNA, mikrosatelity), a je tudíž složité studovat historii jejich šíření. Tento problém byl vyřešen použitím metody ddRAD sekvenování, která poskytla velký počet jednonukleotidových polymorfismů (SNP) napříč celým genomem. Celkově jsme tímto způsobem získali genetická data od 96 jedinců z třiceti lokalit ze sedmi středoevropských zemí. Naše výsledky poprvé ukazují jasnou genetickou strukturu populací myšice temnopásé v Evropě, ve které se zároveň odráží potenciální cesty šíření z východu. Analýza genetické struktury rozlišila tři hlavní populační jednotky ve střední Evropě: v oblasti Panonské pánve, v severní části Evropy (od severního Česka a Slovenska dál na sever) a na Moravě. V rámci takto definovaných populací je navíc patrná i detailnější substruktura. Geografická lokalizace těchto tří hlavních populací naznačuje, že šíření do střední Evropy proběhlo severní a jižní cestou, které se rozdělovaly podél Karpat. Dále se ukazuje, že dochází ke kontaktu mezi jedinci ze severní a panonské populace, což vzbuzuje další otázky o úrovni jejich promíchání a případného potenciálu k expanzi či fluktuaci areálu myšice temnopásé. Rozšíření datasetu o nové lokality umožní získat ucelenější vhled do evoluční historie populací myšice temnopásé v Evropě a pomůže pochopit procesy, které determinují okraj areálu rozšíření a jeho fluktuace.
Czech name
Genetická struktura středoevropských populací myšice temnopásé (Apodemus agrarius)
Czech description
Myšice temnopásá (Apodemus agrarius) je drobný myšovitý hlodavec původem z východní Asie, odkud expandovala přes Rusko až do západní Evropy; její rozšíření tak pokrývá většinu palearktického regionu. Kolonizace střední Evropy proběhla pravděpodobně v průběhu holocénu vlivem klimatických změn, které způsobily vznik otevřenějších habitatů. Kvůli relativně nedávné expanzi nevykazují evropské populace myšice temnopásé výraznou genetickou variabilitu (mtDNA, mikrosatelity), a je tudíž složité studovat historii jejich šíření. Tento problém byl vyřešen použitím metody ddRAD sekvenování, která poskytla velký počet jednonukleotidových polymorfismů (SNP) napříč celým genomem. Celkově jsme tímto způsobem získali genetická data od 96 jedinců z třiceti lokalit ze sedmi středoevropských zemí. Naše výsledky poprvé ukazují jasnou genetickou strukturu populací myšice temnopásé v Evropě, ve které se zároveň odráží potenciální cesty šíření z východu. Analýza genetické struktury rozlišila tři hlavní populační jednotky ve střední Evropě: v oblasti Panonské pánve, v severní části Evropy (od severního Česka a Slovenska dál na sever) a na Moravě. V rámci takto definovaných populací je navíc patrná i detailnější substruktura. Geografická lokalizace těchto tří hlavních populací naznačuje, že šíření do střední Evropy proběhlo severní a jižní cestou, které se rozdělovaly podél Karpat. Dále se ukazuje, že dochází ke kontaktu mezi jedinci ze severní a panonské populace, což vzbuzuje další otázky o úrovni jejich promíchání a případného potenciálu k expanzi či fluktuaci areálu myšice temnopásé. Rozšíření datasetu o nové lokality umožní získat ucelenější vhled do evoluční historie populací myšice temnopásé v Evropě a pomůže pochopit procesy, které determinují okraj areálu rozšíření a jeho fluktuace.
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
—
OECD FORD branch
10613 - Zoology
Result continuities
Project
—
Continuities
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Others
Publication year
2023
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů