Improved 3D Reconstruction of Interphase Chromosomes Based on Nonlinear Diffusion Filtering
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F06%3A00015590" target="_blank" >RIV/00216224:14330/06:00015590 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Improved 3D Reconstruction of Interphase Chromosomes Based on Nonlinear Diffusion Filtering
Original language description
A recently published method for 3D reconstruction of interphase chromosomes based on the fast marching method was extended. A kind of anisotropic diffusion filtering, namely the balanced forward-backward diffusion filtering, was added to the preprocessing phase of the algorithm. The method for finding an optimal arrival time was also modified. The anisotropic diffusion filtering can suppress inhomogeneities in chromosome staining while edges in images are preserved. This leads to better performance forchromosomes that are close to each other.
Czech name
Vylepšení 3D rekonstrukce chromosomů v interfázi založené na nelineárním difúzním filtrování
Czech description
Nedávno publikovaná metoda na rekonstrukci chromozomů v interfázi využívající fast marching metodu byla rozšířena. BDo fáze předzpracování obrazových dat bylo přidáno nelineární difúzní filtrování, jmenovitě balanced backward forward fitrování. Metoda nahledání optimálního času příchodu byla také změněna. Nelineární difůze potlačuje nerovnoměrnosti v intenzitě chromozomů a zároveň zachovává jejich hrany. Toto vše vede k lepším výsledkům prezentované metody.
Classification
Type
D - Article in proceedings
CEP classification
IN - Informatics
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/GP204%2F03%2FD034" target="_blank" >GP204/03/D034: Threedimensional analysis of cell nuclei using image cytometry</a><br>
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2006
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Article name in the collection
Proceedings of PDE-Based Image Processing and Related Inverse Problems
ISBN
3-540-33266-9
ISSN
—
e-ISSN
—
Number of pages
10
Pages from-to
163-173
Publisher name
Springer-Verlag
Place of publication
Berlin
Event location
Oslo, Norway
Event date
Aug 8, 2005
Type of event by nationality
WRD - Celosvětová akce
UT code for WoS article
—