RSurf Texture Descriptor

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F14%3A00074012" target="_blank" >RIV/00216224:14330/14:00074012 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="http://cbia.fi.muni.cz/projects/rsurf-texture-descriptor.html" target="_blank" >http://cbia.fi.muni.cz/projects/rsurf-texture-descriptor.html</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

RSurf Texture Descriptor

Original language description

In biomedical image analysis, object description and classification tasks are very common. Our work relates to the problem of classification of Human Epithelial (HEp-2) cells. Since the crucial part of each classification process is the feature extraction and selection, much attention should be concentrated to the development of proper image descriptors. In this article, we introduce a new efficient texture-based image descriptor for HEp-2 images. We compare proposed descriptor with LBP, Haralick features (GLCM statistics) and Tamura features using the public MIVIA HEp-2 Images Dataset. Our descriptor outperforms all previously mentioned approaches and the kNN classifier based solely on the proposed descriptor achieve the accuracy as high as 91.1%.

Czech name

—

Czech description

—

Type

R - Software

CEP classification

JC - Computer hardware and software

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GBP302%2F12%2FG157" target="_blank" >GBP302/12/G157: Dynamics and Organization of Chromosomes in the Cell Cycle and during Differentiation under Normal and Pathological Conditions</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2014

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID

RSurf

Technical parameters

Software pre výpis vlastností textúry snímku, ktoré je možné použiť pre rozpoznanie a následnú klasifikáciu vstupného obrázku. Program bol vyvinutý pre spracovanie obrázkov HEp-2 buniek nasnímaných fluorescenčným mikroskopom ale obecne je možné ho použiťpre ľubovolný vstup. Implementácia je realizovaná v jazyku C++. Zodpovedné osoby: Tomáš Majtner &lt;majtner@ics.muni.cz&gt; a Roman Stoklasa &lt;rstoki@seznam.cz&gt; Adresa: Fakulta informatiky Masarykovy univerzity, Botanická 68a, 602 00 Brno.

Economical parameters

Tento software predstavuje jednu z popredných aplikácii pre rozpoznávanie HEp-2 buniek a adresuje tým oblasť automatického vyhodnocovania klinických testov pacientov, ktorý trpia napr. nejakou formou autoimúnnych ochorení. Software má pomáhať expertom voblasti autoimúnnej medicíny pri vyhodnocovaní pacientových vzorkov. V súčastnosti je vyhodnocovanie založené na manuálnom spracovaní expertom, čo je pomalý, drahý a velmi subjektívny proces. Automatické nástroje, akým je aj tento software pre analýzu textúry, majú za úlohu zrýchliť, zpresniť a hlavne zlacniť tento proces. Článok popisujúci tento software bol predstavený na prestížnej konferencii ICPR 2014 vo Švédsku, kde sa stretol s pozitívnym ohlasom a niekoľko výskumných skupín prejavilo záujem o jeho vyskúšanie. Zdrojový kód a dokumentácia boli spracované v anglickom jazyku, čo umožňuje využitie software aj zahraničnými expertmi.

Owner IČO

00216224

Owner name

Masarykova univerzita