2D/3D Gabor Features and 2D/3D MPEG-7 EHD Features

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F15%3A00081208" target="_blank" >RIV/00216224:14330/15:00081208 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="http://cbia.fi.muni.cz/projects/2d/3d-gabor--2d/3d-mpeg-7-ehd-features.html" target="_blank" >http://cbia.fi.muni.cz/projects/2d/3d-gabor--2d/3d-mpeg-7-ehd-features.html</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

2D/3D Gabor Features and 2D/3D MPEG-7 EHD Features

Original language description

The recognition of patterns with focus on texture and shape analysis is still very hot topic, especially in biomedical image processing. In this article, we introduce 3D extensions of well-known approaches for this particular area. We focus on the collection of MPEG-7 image descriptors, specifically on the Edge Histogram Descriptor (EHD) and Gabor features, which are the core of the Homogeneous Texture Descriptor (HTD). The proposed extensions are evaluated on the dataset consisting of three classes of3D volumetric biomedical images. Two different classifiers, namely k-NN and Multi-Class SVM, are used to evaluate the proposed algorithms. According to the presented tests, the proposed 3D extensions clearly outperform their 2D equivalents in the classification tasks.

Czech name

—

Czech description

—

Type

R - Software

CEP classification

JC - Computer hardware and software

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GA14-22461S" target="_blank" >GA14-22461S: Development and Study of Methods for Live Cell Quantification</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2015

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID

2D/3D Gabor & MPEG-7 EHD

Technical parameters

Software pre výpis textúrových vlastností snímku na základe aplikovania metód Gabor features a MPEG-7 EHD, ktoré je možné použiť pre rozpoznanie a následnú klasifikáciu vstupného obrázku. Primárnou inováciou je pridaná podpora pre aplikovanie na 3D vstupné data, ktorá doposiaľ nebola definovaná. Program bol vyvinutý pre spracovanie biomedicínskych obrázkov nasnímaných fluorescenčným mikroskopom ale obecne je možné ho použiť pre ľubovolný vstup. Implementácia je realizovaná v jazyku C++. Zodpovedné osoby: Tomáš Majtner &lt;majtner@ics.muni.cz&gt; a David Svoboda&lt;svoboda@fi.muni.cz&gt; Adresa: Fakulta informatiky Masarykovy univerzity, Botanická 68a, 602 00 Brno.

Economical parameters

Tento software predstavuje jednu z popredných aplikácii pre rozpoznávanie 3D volumetrických biomedicínskych dát. Primárne adresuje oblasť automatického rozpoznávania tohto typu snímkov, ktorá má pomocť expertom (hlavne biológom) v zrýchlení a skvalitneníanalýzy obrazu. V súčastnosti sa vyhodnocovanie často vykonáva manuálne, čo je predovšetkým v prípade 3D snímkov náročné, nakoľko sme limitovaný vizualizačnými technikami. Automatické nástroje, akým je aj tento software pre analýzu textúry, majú za úlohu zrýchliť, zpresniť a v neposlednom rade tak zlacniť celý proces analýzy. Článok popisujúci tento software bol predstavený na medzinárodnej konferencii IC3D 2014 v Belgicku, kde sa stretol s pozitívnym ohlasom. Zaznamenali sme tiež požiadavky pre stiahnutie tejto aplikácie. Zdrojový kód aj jeho dokumentácia boli spracované v anglickom jazyku, čo umožňuje využitie software aj zahraničnými expertmi.

Owner IČO

00216224

Owner name

Masarykova univerzita