AlphaFind

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14610%2F24%3A00137317" target="_blank" >RIV/00216224:14610/24:00137317 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://github.com/Coda-Research-Group/AlphaFind" target="_blank" >https://github.com/Coda-Research-Group/AlphaFind</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.5281/zenodo.11085862" target="_blank" >10.5281/zenodo.11085862</a>

Result language
angličtina
Original language name
AlphaFind
Original language description
AlphaFind is a web-based search engine that allows for structure-based search of the entire AlphaFold Protein Structure Database. Uniprot ID, PDB ID, or Gene Symbol is accepted as input – the engine will return the most similar proteins found within AlphaFold DB, with an option for additional search to extend and refine the results. The search results are grouped by their source organism and displayed along with several similarity metrics. 3D visualizations of the structural superposition of the proteins are provided, and text filters can be used to find specific organisms or Uniprot IDs. For details about the methodology and usage, please see the manual. This website is free and open to all users and there is no login requirement.
Czech name
—
Czech description
—

Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Publication year
2024
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID
2024/01
Technical parameters
Programovací jazyky: Systém je vyvíjen pomocí TypeScriptu. Architektura systému: Kódová základna je organizována do tří hlavních komponent: - Školení: Zvládá školení modelů a vytváření indexů - API (Backend): Spravuje backendové služby a zpracování dat. - UI (Frontend): Spravuje uživatelské rozhraní a interakce na straně klienta. Závislosti: AlphaFind využívá USalign pro úlohy strukturálního zarovnání. Nasazení: Aplikace je kontejnerizována pomocí Dockeru, což usnadňuje konzistentní nasazení v různých prostředích. Licencování: Projekt je licencován pod licencí MIT a licencí Apache 2.0. Úplné podrobnosti, včetně pokynů k nastavení a pokynů k použití, naleznete v úložišti AlphaFind GitHub (https://github.com/Coda-Research-Group/AlphaFind).
Economical parameters
Open-source software dostupný zdarma pod licencí MIT. Žádný přímý ekonomický přínos.
Owner IČO
00216224
Owner name
Masaryk University

Similar results(10)