Functional characterization of a novel SBDS gene variant associated with Shwachman-Diamond syndrome
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F25%3A00143680" target="_blank" >RIV/00216224:14740/25:00143680 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://csklg.cz/" target="_blank" >https://csklg.cz/</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Funkční charakterizace nové varianty genu SBDS asociované se Shwachmanovým-Diamondovým syndromem
Original language description
Shwachmanův–Diamondův syndrom (SDS) je vzácné autozomálně recesivní onemocnění charakterizované především dysfunkcí kostní dřeně, exokrinní pankreatickou insuficiencí a abnormalitami skeletu. Přibližně 90 % pacientů s SDS je nositelem patogenních bialelických variant v genu SBDS, který kóduje protein podílející se na sestavování ribozomů. Patogenní varianty SBDS jsou spojeny se sníženou expresí proteinu SBDS a zvýšenou expresí nádorového supresorového proteinu p53. Zde uvádíme funkční charakterizaci dosud nepopsané varianty c.536C>T; p.(Arg179Leu), která byla spolu se známou patogenní variantou c.355T>C; p.(Cys119Arg) přítomna v genu SBDS (NM_016038.4) u 2 pacientů (sourozenců) s SDS. Funkční význam byl hodnocen in vitro pomocí overexprese SBDS s každou výše uvedenou variantou a SBDS divokého typu v buňkách HeLa. Životaschopnost buněk, proliferace a buněčný cyklus byly hodnoceny pomocí průtokové cytometrie, exprese proteinů SBDS a p53 byla sledována pomocí western blotu. Žádná z variant neovlivnila životaschopnost buněk, proliferaci ani buněčný cyklus ve srovnání s divokým typem SBDS. Obě varianty však vedly ke snížené expresi proteinu SBDS. Varianta c.355T>C navíc překvapivě snížila expresi proteinu p53. Naše zjištění potvrzují patogenitu nové varianty c.536C>T. Tato studie zavádí protokol funkčního testování použitelný pro hodnocení klinického významu dalších variant genu SBDS. Tyto poznatky přispívají k hlubšímu pochopení patogeneze SDS.
Czech name
Funkční charakterizace nové varianty genu SBDS asociované se Shwachmanovým-Diamondovým syndromem
Czech description
Shwachmanův–Diamondův syndrom (SDS) je vzácné autozomálně recesivní onemocnění charakterizované především dysfunkcí kostní dřeně, exokrinní pankreatickou insuficiencí a abnormalitami skeletu. Přibližně 90 % pacientů s SDS je nositelem patogenních bialelických variant v genu SBDS, který kóduje protein podílející se na sestavování ribozomů. Patogenní varianty SBDS jsou spojeny se sníženou expresí proteinu SBDS a zvýšenou expresí nádorového supresorového proteinu p53. Zde uvádíme funkční charakterizaci dosud nepopsané varianty c.536C>T; p.(Arg179Leu), která byla spolu se známou patogenní variantou c.355T>C; p.(Cys119Arg) přítomna v genu SBDS (NM_016038.4) u 2 pacientů (sourozenců) s SDS. Funkční význam byl hodnocen in vitro pomocí overexprese SBDS s každou výše uvedenou variantou a SBDS divokého typu v buňkách HeLa. Životaschopnost buněk, proliferace a buněčný cyklus byly hodnoceny pomocí průtokové cytometrie, exprese proteinů SBDS a p53 byla sledována pomocí western blotu. Žádná z variant neovlivnila životaschopnost buněk, proliferaci ani buněčný cyklus ve srovnání s divokým typem SBDS. Obě varianty však vedly ke snížené expresi proteinu SBDS. Varianta c.355T>C navíc překvapivě snížila expresi proteinu p53. Naše zjištění potvrzují patogenitu nové varianty c.536C>T. Tato studie zavádí protokol funkčního testování použitelný pro hodnocení klinického významu dalších variant genu SBDS. Tyto poznatky přispívají k hlubšímu pochopení patogeneze SDS.
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
—
OECD FORD branch
30200 - Clinical medicine
Result continuities
Project
<a href="/en/project/LX22NPO5102" target="_blank" >LX22NPO5102: National institute for cancer research</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2025
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů