Visualization of multi-modal volume segmentation
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F14%3APR27806" target="_blank" >RIV/00216305:26220/14:PR27806 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="http://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/48277-visualization-of-multi-modal-volume-segmentation" target="_blank" >http://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/48277-visualization-of-multi-modal-volume-segmentation</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Visualization of multi-modal volume segmentation
Original language description
It can visualize single- or multi-modal 2D or 3D images in a selected plane, which can be switched. Modalities are switched by left slider, slices are changed by botom slider. Planes are switched by radiobutton group. It can be used for visualization ofthe segmentation, where the segmentation has to be a binary matrix. For the evaluation purposes, the manual segmentation can be input as the third argument. Both segmentation are depicted with different color (red and blue). In this case, the evaluationcoefficients (Jaccard, Dice, Tanimoto, Accuracy, TPR, FNR, FPR and FNR) are computed and shown in table for particular slice and for the whole volume. This may require RoI definition, which can be input as the fourth argument, otherwise the whole image/volume is considered. These coefficients may be obtained the output of the function.
Czech name
—
Czech description
—
Classification
Type
R - Software
CEP classification
IN - Informatics
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/GAP102%2F12%2F1104" target="_blank" >GAP102/12/1104: Study of metabolism and localization of high grade glioma using MR imaging techniques</a><br>
Continuities
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Others
Publication year
2014
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
Multi-modal visualization
Technical parameters
Software je určen pro rozšíření knihoven MATLAB. Knihovna je plně kompatibilní s verzí programu MATLAB 8.3 (R2014a). Software je volně stažitelný.
Economical parameters
bez ekonomických parametrů. Software umožňuje vizualizaci segmentace v multi-modálních 3D obrazech a její vyhodnocení. Je možné jej využít pro porovnání výsledku automatického algoritmu s manuální segmentaci pro ověření funkčnosti daného algoritmu. Je vhodný pro rychlejší zjištění důvodu a místa případného selhání automatického algoritmu, čímž umožňuje zrcyhlení jeho vývoje.
Owner IČO
00216305
Owner name
Ústav telekomunikací