PredictSNP: Robust and Accurate Consensus Classifier for Prediction of Disease-Related Mutations
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26230%2F13%3APR27527" target="_blank" >RIV/00216305:26230/13:PR27527 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="http://loschmidt.chemi.muni.cz/predictsnp/" target="_blank" >http://loschmidt.chemi.muni.cz/predictsnp/</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
PredictSNP: Robust and Accurate Consensus Classifier for Prediction of Disease-Related Mutations
Original language description
This tool estimates the effect of amino acid substitutions on protein function. The predictions are based on the results of the existing tools MAPP, PhD-SNP, PolyPhen-1, PolyPhen-2, SIFT and SNAP. The principle of consensual approach is described in: "Bendl et. al. (2014) PredictSNP: Robust and Accurate Consensus Classifier for Prediction of Disease-Related Mutations. PLoS Computational Biology, 10.". The user interface shows not only the overall results and the results of underlying tools but also theexperimental annotations extracted from PMD and Uniprot databases.
Czech name
—
Czech description
—
Classification
Type
R - Software
CEP classification
JC - Computer hardware and software
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
—
Continuities
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2013
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
PredictSNP
Technical parameters
Pro informace o licenčních podmínkách prosím kontaktujte: Mgr. Michaela Kavková, Výzkumné centrum informačních technologií, Fakulta informačních technologií VUT v Brně, Božetěchova 2, 612 66 Brno, 541 141 470.
Economical parameters
Nástroj je volně dostupný pro akademickou komunitu. Nelze použít pro komerční účely (z důvodu ochrany práv třetích stran - několika integrovaných metod s nesvobodnou licencí).
Owner IČO
00216305
Owner name
Vysoké učení technické v Brně