SoluProt: prediction of soluble protein expression in Escherichia coli

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26230%2F21%3APR36230" target="_blank" >RIV/00216305:26230/21:PR36230 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://loschmidt.chemi.muni.cz/soluprot/" target="_blank" >https://loschmidt.chemi.muni.cz/soluprot/</a>
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
angličtina
Original language name
SoluProt: prediction of soluble protein expression in Escherichia coli
Original language description
A new tool for sequence-based prediction of soluble protein expression in Escherichia coli, SoluProt, was created using the gradient boosting machine technique with the TargetTrack database as a training set. When evaluated against a balanced independent test set derived from the NESG database, SoluProts accuracy of 58.4% and AUC of 0.60 exceeded those of a suite of alternative solubility prediction tools. There is also evidence that it could significantly increase the success rate of experimental protein studies. SoluProt is freely available as a standalone program and a user-friendly webserver at https://loschmidt.chemi.muni.cz/soluprot/.
Czech name
—
Czech description
—

Publication year
2021
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID
SoluProt
Technical parameters
Pro informace o licenčních podmínkách prosím kontaktujte: Mgr. Radka Báčová, Výzkumné centrum informačních technologií, Fakulta informačních technologií VUT v Brně, Božetěchova 2, 612 66 Brno, 541 141 473.
Economical parameters
SoluProt je poskytován jako nezisková webová služba pro vědeckou komunitu.
Owner IČO
00216305
Owner name
Vysoké učení technické v Brně

Similar results(10)