Real-time PCR detection of Little cherry virus 1 (LChV-1) and Little cherry virus 2 (LChV-2) in biological material

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F18%3AN0000045" target="_blank" >RIV/25271121:_____/18:N0000045 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="http://www.vsuo.cz/common/cms_files/02_Real_time_PCR_detekce_viru_LChV_1_a_LChV_2_v_biologickem_materialu.pdf" target="_blank" >http://www.vsuo.cz/common/cms_files/02_Real_time_PCR_detekce_viru_LChV_1_a_LChV_2_v_biologickem_materialu.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Real-time PCR detekce virů Little cherry virus 1 (LChV-1) a Little cherry virus 2 (LChV-2) v biologickém materiálu

Original language description

Cílem metodiky je zavedení nového detekčního systému pro rutinní diagnostiku rostlinných virů LChV-1 a LChV-2, které jsou původci virového onemocnění maloplodost třešně (LChD – Little Cherry Disease). Hostitelskými rostlinami těchto virů jsou zejména třešně a višně. Výskyt LChV-1 byl popsán také na slivoních, broskvoních a mandloních. Choroba způsobuje významné ztráty na výnosu zejména třešní a višní. Navržená metodika detekce virů je založena na principu real-time PCR. Tento přístup umožňuje současnou kvalitativní/kvantitativní detekci obou virů v jedné reakci. Navržený detekční systém byl validován v simplexním/multiplexním uspořádání pro použití s cyklerem Rotor-Gene Q (Qiagen) dle validačního schématu metodiky EPPO (European and Mediterranean Plant Protection Organization) PM7/98(2) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. Využití detekčního systému se předpokládá zejména pro rutinní diagnostiku těchto virů při certifikaci rozmnožovacího materiálu.

Czech name

Real-time PCR detekce virů Little cherry virus 1 (LChV-1) a Little cherry virus 2 (LChV-2) v biologickém materiálu

Czech description

Cílem metodiky je zavedení nového detekčního systému pro rutinní diagnostiku rostlinných virů LChV-1 a LChV-2, které jsou původci virového onemocnění maloplodost třešně (LChD – Little Cherry Disease). Hostitelskými rostlinami těchto virů jsou zejména třešně a višně. Výskyt LChV-1 byl popsán také na slivoních, broskvoních a mandloních. Choroba způsobuje významné ztráty na výnosu zejména třešní a višní. Navržená metodika detekce virů je založena na principu real-time PCR. Tento přístup umožňuje současnou kvalitativní/kvantitativní detekci obou virů v jedné reakci. Navržený detekční systém byl validován v simplexním/multiplexním uspořádání pro použití s cyklerem Rotor-Gene Q (Qiagen) dle validačního schématu metodiky EPPO (European and Mediterranean Plant Protection Organization) PM7/98(2) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. Využití detekčního systému se předpokládá zejména pro rutinní diagnostiku těchto virů při certifikaci rozmnožovacího materiálu.

Type

N_metC - Methodology certified by the authorised body

CEP classification

—

OECD FORD branch

10609 - Biochemical research methods

Project

<a href="/en/project/LO1608" target="_blank" >LO1608: Research Pomological Centre</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2018

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID

978-80-87030-57-8

Regulation ID

UKZUZ 117978/2018

Technical parameters

Osvědčení pod č.j. UKZUZ 117978/2018 o uznání uplatněné certifikované metodiky vydal Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský, Brno. Smlouva o využití výsledku uživatelem byla uzavřena s ÚKZÚZ

Economical parameters

Metodika pro diagnostiku virů LChV-1 a LChV-2 metodou real-time PCR je optimalizována pro současnou detekci obou virů v jedné PCR reakci. Metodika tedy zrychluje, zpřesňuje a zlevňuje jejich diagnostiku. Zpracuje se tak s vyšší citlivostí za stejný čas větší množství vzorků za nižší cenu, sníží se náklady na jednu analýzu, zvýší se příjmy z testů nebo uvolní kapacita laboratoře. Rychlejší odezva laboratoře bude mít též pozitivní dopad na ekonomiku žadatele o vyšetření zdravotního stavu ovocných plodin, neboť může získat výsledky v kratším čase, a tak pružněji reagovat na obdržené výsledky. Odhad ekonomického přínosu pro tyto žadatele je těžko vyčíslitelný, bude záležet na rozsahu nákazy a rychlosti odezvy laboratoře provádějící testy. Další, ekonomicky obtížně vyčíslitelný, pozitivní dopad bude mít využití metodiky pro testování rozmnožovacího materiálu, kdy včasnou detekcí případných pozitivních rostlin bude zabráněno šíření virů množitelským materiálem a tím i budoucím ztrátám na výnosu v dalších letech.

Certification body designation

Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědelský, Hroznová 2, 656 06, Brno

Date of certification

—

Method of use

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů