All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Real-time PCR detection of Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), Strawberry crinkle virus (SCV), Strawberry vein banding virus (SVBV), Strawberry mottle virus (SMoV) and Strawberry polerovirus-1 (SPV-1) in biological material

The result's identifiers

  • Result code in IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F20%3AN0000049" target="_blank" >RIV/25271121:_____/20:N0000049 - isvavai.cz</a>

  • Result on the web

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternative languages

  • Result language

    čeština

  • Original language name

    Real-time PCR detekce virů Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), Strawberry crinkle virus (SCV), Strawberry vein banding virus (SVBV), Strawberry mottle virus (SMoV) a Strawberry polerovirus-1 (SPV-1) v biologickém materiálu

  • Original language description

    Metodika se zaměřuje na zavedení nového detekčního systému pro rutinní diagnostiku rostlinných virů Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), Strawberry crinkle virus (SCV, oba kmeny A i B), Strawberry vein banding virus (SVBV, evropská i kanadská forma), Strawberry mottle virus (SMoV) a Strawberry polerovirus-1 (SPV-1), původců virového onemocnění jahodníku (Fragaria spp. L.). SMYEV je původcem virového okrajového žloutnutí listů jahodníku, SCV způsobuje virovou kadeřavost jahodníku, SVBV virové lemování žilek jahodníku a SMoV virovou strakatost jahodníku, pro virus SPV-1 se zatím v literatuře název konkrétního onemocnění neuvádí. Navržená metodika detekce virů je založena na principu real-time PCR. Tento přístup umožňuje současnou kvalitativní/kvantitativní detekci všech pěti virů v jedné reakci. Navržený detekční systém byl validován v multiplexním uspořádání pro použití s cyklerem Rotor-Gene Q (Qiagen) dle validačního schématu obsaženého v EPPO (European and Mediterranean Plant Protection Organization) PM7/98 (4) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. Využití detekčního systému se předpokládá zejména pro rutinní diagnostiku těchto virů při certifikaci rozmnožovacího materiálu.

  • Czech name

    Real-time PCR detekce virů Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), Strawberry crinkle virus (SCV), Strawberry vein banding virus (SVBV), Strawberry mottle virus (SMoV) a Strawberry polerovirus-1 (SPV-1) v biologickém materiálu

  • Czech description

    Metodika se zaměřuje na zavedení nového detekčního systému pro rutinní diagnostiku rostlinných virů Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), Strawberry crinkle virus (SCV, oba kmeny A i B), Strawberry vein banding virus (SVBV, evropská i kanadská forma), Strawberry mottle virus (SMoV) a Strawberry polerovirus-1 (SPV-1), původců virového onemocnění jahodníku (Fragaria spp. L.). SMYEV je původcem virového okrajového žloutnutí listů jahodníku, SCV způsobuje virovou kadeřavost jahodníku, SVBV virové lemování žilek jahodníku a SMoV virovou strakatost jahodníku, pro virus SPV-1 se zatím v literatuře název konkrétního onemocnění neuvádí. Navržená metodika detekce virů je založena na principu real-time PCR. Tento přístup umožňuje současnou kvalitativní/kvantitativní detekci všech pěti virů v jedné reakci. Navržený detekční systém byl validován v multiplexním uspořádání pro použití s cyklerem Rotor-Gene Q (Qiagen) dle validačního schématu obsaženého v EPPO (European and Mediterranean Plant Protection Organization) PM7/98 (4) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. Využití detekčního systému se předpokládá zejména pro rutinní diagnostiku těchto virů při certifikaci rozmnožovacího materiálu.

Classification

  • Type

    N<sub>metC</sub> - Methodology certified by the authorised body

  • CEP classification

  • OECD FORD branch

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Result continuities

  • Project

    <a href="/en/project/QK1920245" target="_blank" >QK1920245: Research of spreading, biological characteristics and harmfulness of viruses identified in strawberry using newest diagnostic methods (NGS, PCR) as a basis for legislation</a><br>

  • Continuities

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Others

  • Publication year

    2020

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data specific for result type

  • Internal product ID

    978-80-87030-75-2

  • Regulation ID

    UKZUZ 205307/2020

  • Technical parameters

    Osvědčení pod č.j. UKZUZ 205307/2020 o uznání uplatněné certifikované metodiky vydal Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský, Brno. Smlouva o využití výsledku uživatelem byla uzavřena s ÚKZÚZ

  • Economical parameters

    Metodika pro diagnostiku virů SMYEV, SCV, SVBV, SMoV a SPV-1 metodou real-time PCR je optimalizována pro současnou detekci všech virů v jedné PCR reakci, eliminuje se tedy nutnost připravovat pět nezávislých PCR reakcí pro detekci těchto virů. Metodika zrychluje, zpřesňuje a zlevňuje diagnostiku virů SMYEV, SCV, SVBV, SMoV a SPV-1. Laboratoře mohou zpracovat s vyšší citlivostí za stejný čas větší množství vzorků za nižší cenu, což se promítne do ekonomiky laboratoře -snížením nákladů na jednu analýzu, uvolněním kapacity laboratoře pro další testy. Rychlejší odezva bude mít pozitivní dopad na ekonomiku žadatele o testování, jelikož získá výsledky v kratším čase. Odhad ekonomického přínosu pro tyto žadatele je těžko vyčíslitelný, bude záležet na rozsahu nákazy a rychlosti odezvy laboratoře. Pozitivní dopad bude mít využití metodiky pro testování rozmnožovacího materiálu, kdy včasnou detekcí pozitivních rostlin bude zabráněno šíření virů množitelským materiálem a tím i ztrátám na výnosu v dalších letech.

  • Certification body designation

    Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědelský, Hroznová 2, 656 06, Brno

  • Date of certification

  • Method of use

    C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů