Real-time PCR detection of Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), Strawberry crinkle virus (SCV), Strawberry vein banding virus (SVBV), Strawberry mottle virus (SMoV) and Strawberry polerovirus-1 (SPV-1) in biological material
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F20%3AN0000049" target="_blank" >RIV/25271121:_____/20:N0000049 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Real-time PCR detekce virů Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), Strawberry crinkle virus (SCV), Strawberry vein banding virus (SVBV), Strawberry mottle virus (SMoV) a Strawberry polerovirus-1 (SPV-1) v biologickém materiálu
Original language description
Metodika se zaměřuje na zavedení nového detekčního systému pro rutinní diagnostiku rostlinných virů Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), Strawberry crinkle virus (SCV, oba kmeny A i B), Strawberry vein banding virus (SVBV, evropská i kanadská forma), Strawberry mottle virus (SMoV) a Strawberry polerovirus-1 (SPV-1), původců virového onemocnění jahodníku (Fragaria spp. L.). SMYEV je původcem virového okrajového žloutnutí listů jahodníku, SCV způsobuje virovou kadeřavost jahodníku, SVBV virové lemování žilek jahodníku a SMoV virovou strakatost jahodníku, pro virus SPV-1 se zatím v literatuře název konkrétního onemocnění neuvádí. Navržená metodika detekce virů je založena na principu real-time PCR. Tento přístup umožňuje současnou kvalitativní/kvantitativní detekci všech pěti virů v jedné reakci. Navržený detekční systém byl validován v multiplexním uspořádání pro použití s cyklerem Rotor-Gene Q (Qiagen) dle validačního schématu obsaženého v EPPO (European and Mediterranean Plant Protection Organization) PM7/98 (4) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. Využití detekčního systému se předpokládá zejména pro rutinní diagnostiku těchto virů při certifikaci rozmnožovacího materiálu.
Czech name
Real-time PCR detekce virů Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), Strawberry crinkle virus (SCV), Strawberry vein banding virus (SVBV), Strawberry mottle virus (SMoV) a Strawberry polerovirus-1 (SPV-1) v biologickém materiálu
Czech description
Metodika se zaměřuje na zavedení nového detekčního systému pro rutinní diagnostiku rostlinných virů Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), Strawberry crinkle virus (SCV, oba kmeny A i B), Strawberry vein banding virus (SVBV, evropská i kanadská forma), Strawberry mottle virus (SMoV) a Strawberry polerovirus-1 (SPV-1), původců virového onemocnění jahodníku (Fragaria spp. L.). SMYEV je původcem virového okrajového žloutnutí listů jahodníku, SCV způsobuje virovou kadeřavost jahodníku, SVBV virové lemování žilek jahodníku a SMoV virovou strakatost jahodníku, pro virus SPV-1 se zatím v literatuře název konkrétního onemocnění neuvádí. Navržená metodika detekce virů je založena na principu real-time PCR. Tento přístup umožňuje současnou kvalitativní/kvantitativní detekci všech pěti virů v jedné reakci. Navržený detekční systém byl validován v multiplexním uspořádání pro použití s cyklerem Rotor-Gene Q (Qiagen) dle validačního schématu obsaženého v EPPO (European and Mediterranean Plant Protection Organization) PM7/98 (4) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. Využití detekčního systému se předpokládá zejména pro rutinní diagnostiku těchto virů při certifikaci rozmnožovacího materiálu.
Classification
Type
N<sub>metC</sub> - Methodology certified by the authorised body
CEP classification
—
OECD FORD branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK1920245" target="_blank" >QK1920245: Research of spreading, biological characteristics and harmfulness of viruses identified in strawberry using newest diagnostic methods (NGS, PCR) as a basis for legislation</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2020
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
978-80-87030-75-2
Regulation ID
UKZUZ 205307/2020
Technical parameters
Osvědčení pod č.j. UKZUZ 205307/2020 o uznání uplatněné certifikované metodiky vydal Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský, Brno. Smlouva o využití výsledku uživatelem byla uzavřena s ÚKZÚZ
Economical parameters
Metodika pro diagnostiku virů SMYEV, SCV, SVBV, SMoV a SPV-1 metodou real-time PCR je optimalizována pro současnou detekci všech virů v jedné PCR reakci, eliminuje se tedy nutnost připravovat pět nezávislých PCR reakcí pro detekci těchto virů. Metodika zrychluje, zpřesňuje a zlevňuje diagnostiku virů SMYEV, SCV, SVBV, SMoV a SPV-1. Laboratoře mohou zpracovat s vyšší citlivostí za stejný čas větší množství vzorků za nižší cenu, což se promítne do ekonomiky laboratoře -snížením nákladů na jednu analýzu, uvolněním kapacity laboratoře pro další testy. Rychlejší odezva bude mít pozitivní dopad na ekonomiku žadatele o testování, jelikož získá výsledky v kratším čase. Odhad ekonomického přínosu pro tyto žadatele je těžko vyčíslitelný, bude záležet na rozsahu nákazy a rychlosti odezvy laboratoře. Pozitivní dopad bude mít využití metodiky pro testování rozmnožovacího materiálu, kdy včasnou detekcí pozitivních rostlin bude zabráněno šíření virů množitelským materiálem a tím i ztrátám na výnosu v dalších letech.
Certification body designation
Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědelský, Hroznová 2, 656 06, Brno
Date of certification
—
Method of use
C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů