Miniaturized portable system for digital polymerase chain reaction (dPCR)

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25521446%3A_____%2F21%3AN0000004" target="_blank" >RIV/25521446:_____/21:N0000004 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Miniaturizovaný přenosný systém pro digitální polymerázovou řetězovou reakci (dPCR)

Original language description

Miniaturizovaný systém pro digitální polymerázovou řetězovou reakci (dPCR) využívající čip dPCR o velikosti (9×9) mm2 s 26 448 nebo více segmenty (jamkami). Čip dPCR je vyrobený z křemíku. Nejprve jsou pomocí litografie definovány budoucí jamky o průměru 50 µm s použitím hexagonální konfigurace pro maximální využití plochy. Ty jsou pak vyleptány do hloubky 30 µm. dPCR čip je naplněn PCR master mixem s DNA templátem s takovým počtem kopií DNA, že v každém jamce je buď jedna, nebo žádná. Čip dPCR je pokryt krycím sklíčkem pro mikroskopii tak, aby se zabránilo odpařování vody z PCR master mixu. Poté je čip dPCR podroben teplotnímu cyklování mezi teplotou denaturace DNA a teploty nasedání primerů/prodlužování řetězců DNA, aby se zvýšil počet kopií DNA v jamce na detekovatelnou úroveň fluorescenční metodou. Poté je obraz čipu zachycen pomocí fluorescenčního zobrazovacího systému s použitím světlo emitující diody (LED) s hlavní vlnovou délkou 470 nm jako světelným zdrojem a sadou filtrů, jako je fluorescein isothiokyanát (FITC). Obraz čipu na vlnové délce mezi 500 a 550 nm je zachycen kamerou zabudovanou v mobilním telefonu s funkcí supermakro, jako je Huawei P40. Fluorescenční systém je rovněž miniaturizovaný se čtyřmi LED diodami, excitačním filtrem o velikosti (14 × 14) mm2, dichroickým zrcadlem o velikosti (14 × 20) mm2 a emisním filtrem o velikosti (14 × 14) mm2. Čip dPCR je vyhříván/chlazen termoelektrickým článkem řízeným z jednočipového řadiče pomocí systému uzavřené zpětné vazby s metodou proporcionální integrativní derivace (PID). PID koeficienty i parametry teplotního cyklování se načítají do jednoho čipu řízeného přes komunikační protokol Bluetooth z mobilního telefonu. Lze je také načíst pomocí USB rozhraní z PC. Jakmile je získán fluorescenční obraz čipu, je odeslán do externího počítače pomocí komunikace 4G nebo 4G. Po zpracování snímky se výsledky odešlou zpět a zobrazí na displeji mobilního telefonu.

Czech name

Miniaturizovaný přenosný systém pro digitální polymerázovou řetězovou reakci (dPCR)

Czech description

—

Type

G_funk - Functional sample

CEP classification

—

OECD FORD branch

20602 - Medical laboratory technology (including laboratory samples analysis; diagnostic technologies) (Biomaterials to be 2.9 [physical characteristics of living material as related to medical implants, devices, sensors])

Project

<a href="/en/project/LTACH19005" target="_blank" >LTACH19005: High Precision Digital PCR for cfDNA Detection in Noninvasive Prenatal Testing (NIPT) Applications</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2021

Confidentiality

C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.

Internal product ID

Miniaturizovaný přenosný systém pro dPCR

Numerical identification

LTACH19005

Technical parameters

Počet LED：4 Vlnová délka: 470 nm Optický výkon: 5 cd TEC element: (11 x 11) mm2 s výkonem 17 W/cm2 Typ filtrů: sada tři filtrů FITC Typ záznamového zařízení: Mobilní telefon Huawei P40 Rychlost ohřívání a chlazení: více než 10 K/s

Economical parameters

Návrh, výzkum, vývoj, následná výroba a odzkoušení funkčního vzorku byla realizována v projektu LTACH19005 realizovaného v rámci podprogramu INTER-ACTION (LTACH), programu INTER-EXCELLENCE, zde jsou vyčísleny jednotlivé náklady na jeho tvorbu.

Application category by cost

—

Owner IČO

25521446

Owner name

ROKOSPOL a.s.

Owner country

CZ - CZECH REPUBLIC

Usage type

V - Výsledek je využíván vlastníkem

Licence fee requirement

N - Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje licenční poplatek

Web page

nepublikováno na webu