Detection of gene-specific microsatellite markers red clover

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26296080%3A_____%2F14%3A%230001189" target="_blank" >RIV/26296080:_____/14:#0001189 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/00216224:14310/14:00073263

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Detekce genově specifických mikrosatelitních markerů jetele lučního

Original language description

Metodický postup a řešení se týká navržení sady mikrosatelitních markerů ve specifických genech Trifolium pratense (jetel luční) definovaných na základě vlastního sekvenování další generace. Zahrnuje druhově specifické SSR markery v kódujících sekvencích(exonech) genů pro desaturázy, polyfenoloxidázy a noduliny, které jsou součástí metabolických drah biosyntézy mastných kyselin, důležitých pro kvalitu bílkovin a pro fixaci dusíku, a dále zahrnuje SSR markery v genech pro rezistenci a pro výnosové charakteristiky. Metodika se také vztahuje k postupu amplifikace cílových sekvencí SSR markerů pomocí specifických sond. Testovací sada mikrosatelitních markerů je určena pro oblast šlechtění jetele lučního.

Czech name

Detekce genově specifických mikrosatelitních markerů jetele lučního

Czech description

Metodický postup a řešení se týká navržení sady mikrosatelitních markerů ve specifických genech Trifolium pratense (jetel luční) definovaných na základě vlastního sekvenování další generace. Zahrnuje druhově specifické SSR markery v kódujících sekvencích(exonech) genů pro desaturázy, polyfenoloxidázy a noduliny, které jsou součástí metabolických drah biosyntézy mastných kyselin, důležitých pro kvalitu bílkovin a pro fixaci dusíku, a dále zahrnuje SSR markery v genech pro rezistenci a pro výnosové charakteristiky. Metodika se také vztahuje k postupu amplifikace cílových sekvencí SSR markerů pomocí specifických sond. Testovací sada mikrosatelitních markerů je určena pro oblast šlechtění jetele lučního.

Type

N_metC - Methodology certified by the authorised body

CEP classification

GF - Diseases, pests, weeds and plant protection

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/QI111A019" target="_blank" >QI111A019: New genomic technology for the alogamic cultivated plant breeding for improving utility traits.</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2014

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID

Metodika 25/14

Regulation ID

A

Technical parameters

Metodika bude využita v oblasti diagnostiky genotypů jetele pro získání nových zdrojů diverzity využitelných při tvorbě nového šlechtitelského materiálu pro vyšlechtění odrůdy s požadovanými hospodářskými znaky jako je odolnost k patogenům, zlepšená fixace dusíku a vyšší obsah polyfenoloxidáz důležitých pro výživářské parametry. Diagnostické markery jsou funkční (kauzální) markery v cílových genech. Takové soubory SSR markerů jetele je možné využít v populačních studiích ve šlechtění jetele lučního při1) charakterizaci rozsáhlých kolekcí genových bank pro vyloučení duplicit, 2) odlišení odrůd, 3) asociačních studiích a detekci markerů v genetické vazbě s hospodářsky významnými geny (MAS; marker assisted selection).

Economical parameters

Metodika vychází z potřeby maximálně optimalizovat šlechtitelský proces, protože tvorba nových odrůd jetele lučního je dlouhodobá záležitost. Hlavním záměrem je uplatnění nových metod skríningu a diagnostiky ve šlechtění jetele lučního založených na molekulárně genetických metodách. Aplikace těchto metod bude znamenat zvýšení efektivnosti šlechtění, jeho výrazné urychlení a tím i ekonomický efekt.

Certification body designation

Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský, Hroznová 2, 656 02 Brmo

Date of certification

—

Method of use

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů