MemSkel - software for segmentation of cell membrane
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F49777513%3A23520%2F12%3A43918038" target="_blank" >RIV/49777513:23520/12:43918038 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/memskel" target="_blank" >http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/memskel</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
MemSkel - program pro segmentaci buněčné membrány
Original language description
MemSkel je nástroj pro segmentaci buněčné membrány z mikroskopických snímků. Vstupem programu je mikroskopický snímek získaný horizontální resp. vertikální polarizací. Výstupem programu je binární maska, určující buněčnou membránu a její střednice získaná pomocí metod zpracování obrazu, konkrétně pomocí skeletonizace. Takto získaná střednice je dále aproximována b-splinou, která tvoří druhý výstup programu. Software rovněž podporuje automatické zpracování více-snímkových dat.
Czech name
MemSkel - program pro segmentaci buněčné membrány
Czech description
MemSkel je nástroj pro segmentaci buněčné membrány z mikroskopických snímků. Vstupem programu je mikroskopický snímek získaný horizontální resp. vertikální polarizací. Výstupem programu je binární maska, určující buněčnou membránu a její střednice získaná pomocí metod zpracování obrazu, konkrétně pomocí skeletonizace. Takto získaná střednice je dále aproximována b-splinou, která tvoří druhý výstup programu. Software rovněž podporuje automatické zpracování více-snímkových dat.
Classification
Type
R - Software
CEP classification
JD - Use of computers, robotics and its application
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
—
Continuities
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Others
Publication year
2012
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
MemSkel
Technical parameters
Software je používán pro analýzu lineárního dichroismu. Získání licence a/nebo bližších informací: Tomáš Ryba, tryba@kky.zcu.cz, 377632584, http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/memskel
Economical parameters
Využití interaktivity a automatizace poskytované vyvinutým nástrojem slouží k signifikantní úspoře času. Uživatel již nemusí manuálně umisťovat uzly spliny do obrázku (cca 50 uzlů na jeden snímek), v případě více-snímkových dat je časová úspora markantnější. Z Bližší informace: Tomáš Ryba, tryba@kky.zcu.cz, 377632584, http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/memskel .
Owner IČO
49777513
Owner name
Katedra kybernetiky, Fakulta aplikovaných věd, Západočeská univerzita v Plzni