Assessment of genetic diversity of caraway (Carum carvi L.) genetic resources using ISSR markers

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12220%2F25%3A43910329" target="_blank" >RIV/60076658:12220/25:43910329 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="https://www.vupt.cz/storage/app/media/Avanti/Sbornik_2025.pdf" target="_blank" >https://www.vupt.cz/storage/app/media/Avanti/Sbornik_2025.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Hodnocení genetické diverzity genetických zdrojů kmínu obecného (Carum carvi L.) s využitím ISSR markerů

Original language description

V této studii byly použity markery Inter-simple sequence repeat (ISSR) k vyhodnocení genetickédiverzity u 36 odrůd kmínu obecného (Carum carvi L.) různého geografického původu. Šest ISSRprimerů generovalo celkem 55 skórovatelných markerů, z nichž 49 (89 %) bylo polymorfních.Genetická podobnost vyjádřená Jaccardovým koeficientem se pohybovala od 0,22 do 0,88, což odrážíznačnou variabilitu mezi analyzovanými položkami genetických zdrojů. Neiova genová diverzita (H =0,33) a Shannonův index diverzity (I = 0,50) naznačovaly střední diverzitu v rámci sledovanéhosouboru. Vnitropopulační variabilita byla na úrovni 62% a mezipopulační variabilita naúrovni 38%(AMOVA, ΦST = 0,3785, p &lt; 0,001). České odrůdy vykazovaly nejvyšší diverzitu (H = 0,261), zatímconejnižší diverzita byla zjištěna mezi položkami genetických zdrojů z bývalého Sovětského svazu (H =0,082). Tato zjištění ukazují, že ISSR markery jsou vysoce informativní pro detekci genetické variabilityu kmínu.

Czech name

Hodnocení genetické diverzity genetických zdrojů kmínu obecného (Carum carvi L.) s využitím ISSR markerů

Czech description

V této studii byly použity markery Inter-simple sequence repeat (ISSR) k vyhodnocení genetickédiverzity u 36 odrůd kmínu obecného (Carum carvi L.) různého geografického původu. Šest ISSRprimerů generovalo celkem 55 skórovatelných markerů, z nichž 49 (89 %) bylo polymorfních.Genetická podobnost vyjádřená Jaccardovým koeficientem se pohybovala od 0,22 do 0,88, což odrážíznačnou variabilitu mezi analyzovanými položkami genetických zdrojů. Neiova genová diverzita (H =0,33) a Shannonův index diverzity (I = 0,50) naznačovaly střední diverzitu v rámci sledovanéhosouboru. Vnitropopulační variabilita byla na úrovni 62% a mezipopulační variabilita naúrovni 38%(AMOVA, ΦST = 0,3785, p &lt; 0,001). České odrůdy vykazovaly nejvyšší diverzitu (H = 0,261), zatímconejnižší diverzita byla zjištěna mezi položkami genetických zdrojů z bývalého Sovětského svazu (H =0,082). Tato zjištění ukazují, že ISSR markery jsou vysoce informativní pro detekci genetické variabilityu kmínu.

Type

J_ost - Miscellaneous article in a specialist periodical

CEP classification

—

OECD FORD branch

40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology

Project

<a href="/en/project/QL24010185" target="_blank" >QL24010185: Complex technology of caraway (Carum carvi L.) growing in changing climatic conditions withemphasis on quality parameters of production.</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2025

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Úroda

ISSN

0139-6013

e-ISSN

—

Volume of the periodical

LXXIII

Issue of the periodical within the volume

12

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

7

Pages from-to

57-63

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—