CAMEX

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12520%2F20%3A43901552" target="_blank" >RIV/60076658:12520/20:43901552 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="http://auc.cz/software/2020.php" target="_blank" >http://auc.cz/software/2020.php</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

CAMEX

Original language description

Účelem CAMEXu je kalibrovat obrázky a vizuálně je analyzovat. Nástroj CAMEX umožňuje spustit složku se sekvencí primárních obrazových dat jako video. Primární obraz vybraný z videa lze dále analyzovat (prostřednictvím debayerizace, prahování, výběru oblasti zájmu roi, histogramu roi). Softwarový nástroj umožňuje pracovat s digitálním fotoaparátem. V tuto chvíli jsou ovladače kompatibilní s fotoaparáty značky Ximea. Hlavní využití CAMEXu je nicméně v kalibraci a korekci obrazu pomocí postupu uvedeného v Lonhus et al. Sci. Rep. 10, 18346, 2020. První výpočetním vstupem je sada spekter světla (např. zdroje světla mikroskopu) sbíraných při změně expozice kamery (mikroskopu). Tvar primárního světelného spektra je sejmut optovláknovým spektrofotometrem. Druhým výpočetním vstupem je sada snímků závislá na expozici kamery (mikroskopu). Světelná spektra a příslušné obrazy jsou číslovány postupně ve vzestupném pořadí. Algoritmus poté vytvoří pro každý pixel kalibrační křivku (světelná energie vs. intenzita pixelu). Jinými slovy, na pozici každého pixelu kamery se takto získá informace o odezvě celé optické dráhy a citlivosti pixelu kamery. Posledním vstupem algoritmu je (mikroskopická) sekvence primárních obrazových dat. Pomocí dalšího algoritmu získáme jako výstup sadu snímků, kde jsou oproti původním snímkům potlačeny optické vady jako vignetace, přítomnost nežádoucích částic prachu a elektrický šum fotoaparátu. Pozadí obrazu je tedy homogennější. Výstupy algoritmu lze uložit ve formátu desetinného čísla (v souborech *.mat). Pokud je jako výstup zvolen jakýkoliv obrazový formát, doporučuje se, aby výstupní obrazový signál měl vyšší (tj. 14- nebo 16-) bitovou hloubku než vstupní signál (ten má většinou 12 bitů).

Czech name

CAMEX

Czech description

Účelem CAMEXu je kalibrovat obrázky a vizuálně je analyzovat. Nástroj CAMEX umožňuje spustit složku se sekvencí primárních obrazových dat jako video. Primární obraz vybraný z videa lze dále analyzovat (prostřednictvím debayerizace, prahování, výběru oblasti zájmu roi, histogramu roi). Softwarový nástroj umožňuje pracovat s digitálním fotoaparátem. V tuto chvíli jsou ovladače kompatibilní s fotoaparáty značky Ximea. Hlavní využití CAMEXu je nicméně v kalibraci a korekci obrazu pomocí postupu uvedeného v Lonhus et al. Sci. Rep. 10, 18346, 2020. První výpočetním vstupem je sada spekter světla (např. zdroje světla mikroskopu) sbíraných při změně expozice kamery (mikroskopu). Tvar primárního světelného spektra je sejmut optovláknovým spektrofotometrem. Druhým výpočetním vstupem je sada snímků závislá na expozici kamery (mikroskopu). Světelná spektra a příslušné obrazy jsou číslovány postupně ve vzestupném pořadí. Algoritmus poté vytvoří pro každý pixel kalibrační křivku (světelná energie vs. intenzita pixelu). Jinými slovy, na pozici každého pixelu kamery se takto získá informace o odezvě celé optické dráhy a citlivosti pixelu kamery. Posledním vstupem algoritmu je (mikroskopická) sekvence primárních obrazových dat. Pomocí dalšího algoritmu získáme jako výstup sadu snímků, kde jsou oproti původním snímkům potlačeny optické vady jako vignetace, přítomnost nežádoucích částic prachu a elektrický šum fotoaparátu. Pozadí obrazu je tedy homogennější. Výstupy algoritmu lze uložit ve formátu desetinného čísla (v souborech *.mat). Pokud je jako výstup zvolen jakýkoliv obrazový formát, doporučuje se, aby výstupní obrazový signál měl vyšší (tj. 14- nebo 16-) bitovou hloubku než vstupní signál (ten má většinou 12 bitů).

Type

R - Software

CEP classification

—

OECD FORD branch

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Project

—

Continuities

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Publication year

2020

Confidentiality

C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.

Internal product ID

CAMEX

Technical parameters

Více na http://www.auc.cz/software/doc/camex.pdf. Osoba odpovědná pro jednání: Ing. Renata Rychtáriková, FROV JČU, Zámek 136, 373 33 Nové Hrady, email: rrychtarikova@frov.jcu.cz, telefon: +420 38777 3833

Economical parameters

Jako součást pokročilý ovladač a systém zpracování obrazu jakékoliv kamery je předpokládaný zisk jednotky mil. EUR/rok.

Owner IČO

60076658

Owner name

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích