Crystals of DhaA mutants from Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064 diffracted to ultrahigh resolution: crystallization and preliminary diffraction analysis

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12640%2F08%3A00009369" target="_blank" >RIV/60076658:12640/08:00009369 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Crystals of DhaA mutants from Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064 diffracted to ultrahigh resolution: crystallization and preliminary diffraction analysis

Original language description

The enzyme DhaA from Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064 belongs to the haloalkane dehalogenases, which catalyze the hydrolysis of haloalkanes to the corresponding alcohols. The haloalkane dehalogenase DhaA and its variants can be used to detoxify the industrial pollutant 1,2,3-trichloropropane (TCP). Three mutants named DhaA04, DhaA14 and DhaA15 were constructed in order to study the importance of tunnels connecting the buried active site with the surrounding solvent to the enzymatic activity. All protein mutants were crystallized using the sitting-drop vapour-diffusion method. The crystals of DhaA04 belonged to the orthorhombic space group P2(1)2(1)2(1), while the crystals of the other two mutants DhaA14 and DhaA15 belonged to the triclinic space group P1. Native data sets were collected for the DhaA04, DhaA14 and DhaA15 mutants at beamline X11 of EMBL, DESY, Hamburg to the high resolutions of 1.30, 0.95 and 1.15 angstrom, respectively.

Czech name

Krystaly mutantů DhaA z Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064 difraktující do ultra vysokého rozlišení: krystalizace a předběžná difrakční analýza

Czech description

Enzym DhaA z Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064 patří do skupiny haloalkan dehalogenas, které katalyzují hydrolýzu halogenovaných alkanů na příslušné alkoholy. Haloalkan dehalogenasa DhaA a její mutantní varianty můžou být použity k detoxikaci průmyslových polutantů, např. 1,2,3-trichloropropanu (TCP). Tři mutanty DhaA04, DhaA14 a DhaA15 byly připraveny ke studiu významu tunelů spojujících aktivní místo s okolním solventem. Všechny mutanty byly krystalizovány metodou difůze par v sedící kapce. KrystalyDhaA04 krystalizují v rombické prostorové grupě P212121 zatímco krystaly zbylých dvou mutantů DhaA14 a DhaA15 v triklinické P1. Difrakční data byla naměřena na synchrotronu DESY/EMBL (Hamburk, Německo) do vysokých rozlišení 1.30 ?, 0.95 ? a 1.15

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

BO - Biophysics

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/LC06010" target="_blank" >LC06010: Center of Biocatalysis and Biotransformation</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Acta Crystallographica Section F-Structural Biology and Crystallization Communications

ISSN

1744-3091

e-ISSN

—

Volume of the periodical

64

Issue of the periodical within the volume

x

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

4

Pages from-to

—

UT code for WoS article

000252817400021

EID of the result in the Scopus database

—