Application of the MIS Sherlock method for strain diversity characterization of soil bacterial community
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F06%3A00040220" target="_blank" >RIV/60077344:_____/06:00040220 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Využití metody MIS Sherlock pro charakterizaci druhové diverzity půdního bakteriálního společenstva
Original language description
Půdní bakterie představují nejpočetnější složku edafonu. Identifikace a determinace neznámých mikroorganismů je důležitá pro pochopení funkce a vztahů v ekosystému. Dostupným systémem pro automatickou druhovou identifikaci mikroorganismů na základě analýzy mastných kyselin je MIS Sherlock (MIDI, Newark, DE, USA). Dominantní kmeny bakterií, vyizolované během terénního experimentu, byly identifikovány tímto systémem. Pomocí automatické identifikace systémem MIS Sherlock se podařilo určit 40% dominant do druhu. Dominanty bakterií, které nebyly automatickou identifikací určeny do druhu, byly dále determinovány pomocí klastrové analýzy (Dendrogram cluster analysis - DCA). Zpřesněnou determinací byla přiřazena druhová příslušnost 61% ze všech dominant. Taktoupřesněná data umožní vyšší efektivitu následných statistických analýz, které se týkají druhové diverzity bakteriálního společenstva.
Czech name
Využití metody MIS Sherlock pro charakterizaci druhové diverzity půdního bakteriálního společenstva
Czech description
Půdní bakterie představují nejpočetnější složku edafonu. Identifikace a determinace neznámých mikroorganismů je důležitá pro pochopení funkce a vztahů v ekosystému. Dostupným systémem pro automatickou druhovou identifikaci mikroorganismů na základě analýzy mastných kyselin je MIS Sherlock (MIDI, Newark, DE, USA). Dominantní kmeny bakterií, vyizolované během terénního experimentu, byly identifikovány tímto systémem. Pomocí automatické identifikace systémem MIS Sherlock se podařilo určit 40% dominant do druhu. Dominanty bakterií, které nebyly automatickou identifikací určeny do druhu, byly dále determinovány pomocí klastrové analýzy (Dendrogram cluster analysis - DCA). Zpřesněnou determinací byla přiřazena druhová příslušnost 61% ze všech dominant. Taktoupřesněná data umožní vyšší efektivitu následných statistických analýz, které se týkají druhové diverzity bakteriálního společenstva.
Classification
Type
D - Article in proceedings
CEP classification
EH - Ecology - communities
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2006
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Article name in the collection
Život v pode 7
ISBN
80-223-2162-1
ISSN
—
e-ISSN
—
Number of pages
20
Pages from-to
274-283
Publisher name
Československá spoločnosť mikrobiologická
Place of publication
Bratislava
Event location
Bratislava
Event date
Jan 24, 2006
Type of event by nationality
EUR - Evropská akce
UT code for WoS article
—