Fish-isolated Naegleria strains and their phylogeny inferred from ITS and SSU rDNA sequences

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F06%3A00049005" target="_blank" >RIV/60077344:_____/06:00049005 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60076658:12310/06:00006837

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Fish-isolated Naegleria strains and their phylogeny inferred from ITS and SSU rDNA sequences

Original language description

Eighteen fish-isolated strains studied enlarged substantially the so far available set of Naegleria strains characterized by both molecular markers. The phylogenetic analyses of separate and concatenated SSU rDNA and ITS sequences revealed phylogenetic relationships of strains under study, however, they failed to solve classification of fish-isolated strains into species. The sequence similarity of strain-representatives of Naegleria species as well as data obtained on intragenomic variation of ITS sequences discouraged the authors from the definition of new species using present strategy. The results of study provided evidence of a need to reevaluate current practice of setting boundaries between species of the genus Naegleria.

Czech name

Kmeny rodu Naegleria izolované z ryb a jejich fylogeneze odvozená z ITS a SSU rDNA sekvencí

Czech description

Fylogenetické analýzy sekvencí SSU rDNA a ITS provedené samostatně i v konkatenované podobě u 18 kmenů rodu Naegleria, které byly izolovány z ryb, prokázaly fylogenetické vztahy studovaných kmenů ale neumožnily jejich druhovou determinaci. Podobnost sekvencí u kmenů reprezentujících jednotlivé druhy a data získaná o intragenomové variabilitě ITS sekvencí odradily autory od popisu nových druhů. Práce se kriticky vyslovila ke kriteriím používaným v současné praxi k definování nových druhů.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EG - Zoology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/LC522" target="_blank" >LC522: ICHTHYOPASITOLOGY RESEARCH CENTRE</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Folia Parasitologica

ISSN

0015-5683

e-ISSN

—

Volume of the periodical

53

Issue of the periodical within the volume

3

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

9

Pages from-to

172-180

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—