Conserved synteny of genes between chromosome 15 of Bombyx mori and a chromosome of Manduca sexta shown by five-color BAC-FISH

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F07%3A00090842" target="_blank" >RIV/60077344:_____/07:00090842 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60076658:12310/07:00008830

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Conserved synteny of genes between chromosome 15 of Bombyx mori and a chromosome of Manduca sexta shown by five-color BAC-FISH

Original language description

Conserved synteny of genes between particular chromosomes can be identified by comparatively mapping orthologous genes of the corresponding linkage groups with the help of BAC-FISH. This technique was established in Bombyx mori for two differently labeled BAC probes simultaneously hybridized to pachytene bivalents. In order to achieve higher-throughput comparative mapping using BAC-FISH in Lepidoptera, we developed a protocol for five-color BAC-FISH, which allowed us to map simultaneously six differentBAC probes to chromosome 15 in B. mori. We identified orthologs of six B. mori LG15 genes (RpP0, RpS8, RpL7A, eIF3, RpS23, and Hsc70) for the tobacco hornworm, Manduca sexta, and selected the ortholog-containing BAC clones from an M. sexta BAC library. All six M. sexta BAC clones hybridized to a single M. sexta bivalent in pachytene spermatocytes. Thus, we have confirmed the conserved synteny between the B. mori chromosome 15 and the corresponding M. sexta chromosome.

Czech name

Zachovaná syntenie genů mezi chromosomem 15 u Bombyx mori a jedním chromosomem u Manduca sexta prokázaná pětibarevnou BAC-FISH

Czech description

Zachovanou syntenie genů mezi určitými chromosomy lze identifikovat srovnávacím mapováním ortologních genů odpovídající vazebné skupiny pomocí BAC-FISH. Tato technika byla zavedena u Bombyx mori pro dvě různě značené BAC-sondy simultánně hybridizované kpachytenním bivalentům. Abychom u motýlů dosáhli vyšší kapacity srovnávacího mapování pomocí BAC-FISH, vyvinuli jsme protokol pro pětibarevnou BAC-FISH, která nám umožnila simultánně mapovat šest ruzných BAC-sond na chromosomu 15 u B. mori. Dále jsme identifikovali ortology šesti genů z vazebné skupiny 15 B. mori (RpP0, RpS8, RpL7A, eIF3, RpS23, and Hsc70) u lišaje tabákového, Manduca sexta, a z BAC-knihovny M. sexta selektovali BAC-klony obsahující tyto ortology. Všech šest BAC-klonů M. sexta hybridizovalo v pachytenních spermatocytech k jedinému bivalentu M. sexta. Naše výsledky tak potvrdily zachovanou syntenii mezi chromosomem 15 u Bombyx mori a odpovídajícím chromosomem u M. sexta.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GA206%2F06%2F1860" target="_blank" >GA206/06/1860: Molecular evolution of sex chromosomes in Lepidoptera</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>O - Projekt operacniho programu

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Genome

ISSN

0831-2796

e-ISSN

—

Volume of the periodical

50

Issue of the periodical within the volume

11

Country of publishing house

CA - CANADA

Number of pages

5

Pages from-to

1061-1065

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—