Effects of cattle husbandry on abundance and activity of methanogenic archaea in upland soils

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F07%3A00092677" target="_blank" >RIV/60077344:_____/07:00092677 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Effects of cattle husbandry on abundance and activity of methanogenic archaea in upland soils

Original language description

In the present study, we tested the hypothesis that animal treading associated with a high input of organic matter would favour methanogenesis in soils used as overwintering pasture. Hence, methane emissions and methanogen populations were examined at sections with different degree of cattle impact in a Farm in South Bohemia, Czech Republic. In spring, methane emission positively corresponded to the gradient of animal impact. Applying phospholipid etherlipid analysis, the highest archaeal biomass was found in section severe impact (SI), followed by moderate impact (MI) and no impact. The same trend was observed for the methanogens as showed by real-time quantitative PCR analyses of methyl coenzyme M reductase (mcrA) genes. The detection of monounsaturated isoprenoid side chain hydrocarbons (i20:1) indicated the presence of acetoclastic methanogens in the cattle-impacted sites.

Czech name

Vlivy chovu skotu na abundanci a aktivitu methanogenního společenstva archeí v horských půdách

Czech description

V této studii jsme testovali hypotézu, jestli sešlapování zvířaty společně s vysokým vstupem organické hmoty bude podporovat methanogenezi v půdách užívaných jako zimoviště. Proto byly zkoumány emise methanu a populace methanogenů na plochách různě zatížených pobytem zvířat na farmě v jižních Čechách (Česká republika). V jarním období emise methanu pozitivně korelovaly s gradientem zátěže zvířat. Použitím fosfolipid-etherlipid analýzy bylo zjištěno, že nejvyšší biomasa archeí se nachází na ploše s nejvyšší zátěží (SI), poté na středně zatížené (MI) a nejnižší na kontrolní půdě. Stejný trend byl zaznamenán pro methanogenní archea, jak bylo ukázáno pomocí real-time kvantitativní PCR analýzy genů pro methyl koenzym M reduktázu (mcrA). Detekce mononenasycených isoprenoidů v postranních řetězcích uhlovodíků (i20:1) naznačovala přítomnost "acetoclastic" methanogenů na plochách ovlivněných skotem. Tento výsledek byl potvrzen fylogenetickou analýzou mcrA sekvencí získaných z plochy SI.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EH - Ecology - communities

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

The ISME Journal

ISSN

1751-7362

e-ISSN

—

Volume of the periodical

-

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

10

Pages from-to

443-452

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—