An effect of 16S rRNA intercistronic variability on coevolutionary analysis in symbiotic bacteria: Molecular phylogeny of Arsenophonus triatominarum

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F08%3A00319110" target="_blank" >RIV/60077344:_____/08:00319110 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60076658:12310/08:00009186

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

An effect of 16S rRNA intercistronic variability on coevolutionary analysis in symbiotic bacteria: Molecular phylogeny of Arsenophonus triatominarum

Original language description

In this study, we show that in Arsenophonus triatominarum the degree of heterogeneity can affect reconstruction of phylogenetic relationships and mask possible coevolution between the symbiont and its host. Phylogenetic arrangement of individual rRNA copies was used, together with a calculation of their divergence time, to demonstrate that the incongruent 16S rDNA trees and low nucleotide diversity in the secondary symbiont could be reconciled with the coevolutionary scenario.

Czech name

Vliv intercistronické variability 16S RNA na koevoluční analýzu symbiotických bakterií: molekulární fylogeneze bakterie Arsenophonus triatominarum

Czech description

Studie ukazuje na příkladu symbiotické bakterie Arsenophonus triatominarum, že vnitrogenomová variabilita může ovlivňovat rekonstrukci fylogenetických vztahů a zakrýt případnou koevoluci mezi symbiontem a hostitelem. Fylogenetické uspořádání 16S RNA, společně s výpočtem divergenčních časů, ukazuje, že inkongruence mezi 16S RNA stromy a nízká genetická diverzita mohou být v souladu s koevoluční hypotézou.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EE - Microbiology, virology

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Systematic and Applied Microbiology

ISSN

0723-2020

e-ISSN

—

Volume of the periodical

31

Issue of the periodical within the volume

2

Country of publishing house

DE - GERMANY

Number of pages

13

Pages from-to

—

UT code for WoS article

000258027300002

EID of the result in the Scopus database

—