Statistical correlations of primer thermodynamic stability delta G0 for enhanced flax ISSR-PCR cultivar authentication

Result code in IS VaVaI

RIV/60077352:_____/04:00102843 - isvavai.cz

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Statistical correlations of primer thermodynamic stability delta G0 for enhanced flax ISSR-PCR cultivar authentication

Original language description

We revealed four statistically significant correlations related to inter-simple-sequence repeat :ISSR patterns: 1 between free energy G0 of ISSR primer and the reamplification intensity :dAi, 2 between free energy G0 of ISSR primer and PIC coefficient, 3resp. 4 between free energy G0 of anchor sequence of primer and the number of total, resp. polymorphic bands in ISSR patterns. Methodological recommendations for effective ISSR primer design were inferred based on revealed correlations.

Czech name

Statistické korelace termodynamické stability PCR primerů ?G0 pro kvalitnější identifikaci kultivarů lnu užitím ISSR-PCR metody

Czech description

Nalezli jsme čtyři statisticky významné korelace vztahující se ke gelovým spektrům ISSR-PCR: 1 mezi volnou energií ?G0 ISSR primeru a intenzitou reamplifikace PCR: dAi, 2 mezi volnou energií ?G0 ISSR primeru a PIC koeficientem, 3 resp. 4 mezi volnou energií ?G0 sekvenční kotvy primeru a počtem veškerých, resp. polymorfních pruhů v ISSR spektrech. Z těchto korelací byla vyvozena metodická doporučení pro efektivnější navrhování ISSR primerů.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

GA521/03/0019: Isolation of hypervariable microsatellites suitable for identification of flax germplasm.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Journal of Agricultural and Food Chemistry

ISSN

0021-8561

e-ISSN

—

Volume of the periodical

52

Issue of the periodical within the volume

-

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

4

Pages from-to

2568-2571

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—