Approaches applied in study of soil microbial diversity in brown coal post-mining chronosequences

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077379%3A_____%2F04%3A00110140" target="_blank" >RIV/60077379:_____/04:00110140 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Approaches applied in study of soil microbial diversity in brown coal post-mining chronosequences

Original language description

Soil microbial community of colliery spoil heaps during primary succession (succession plots: initial [0] - early [10] - mid [20] - late [42 years old], Sokolov, North-West Bohemia) was studied by using both phenotyping methods (phospholipid fatty acids- PLFA pattern, carbon utilisation patterns - Biolog System, dominant heterotrophic bacterial species - Sherlock MIDI System) and genotyping method (ARDRA - Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis). PLFA pattern was clearly different among individual succession stage as well as among the top (0-5 cm) and the mineral (10-15 cm) layer. The PLFA biomarkers indicated that the initial and the early stages were enriched by actinobacteria; the mid stage by Gram negative bacteria and fungi; the late stagewas characteristic by the development of microeukaryota. The Biolog System showed significant functional diversity of microbial communities only between late and the younger succession stages. The community on the late stage was charac...

Czech name

Přístupy použité při studii půdní mikrobiální diverzity na hnědouhelných výsypkách

Czech description

Bylo studováno společenstvo půdních mikroorganismů na hnědouhelných výsypkách (sukcesní plochy: počáteční 0 ? raná 10 ? prostřední 20 ? pozdní 42 let stará, lokalita Sokolov, Severozápadní Čechy) pomocí fenotypových metod (Sherlock MIDI System ? screening dominantních heterotrofních druhů, PLFA ? fosfolipidické mastné kyseliny, Biolog System - analýza využití C ? substrátů) a genotypových (ARDRA ? restrikční analýza amplifikované ribozomální DNA). PLFA profily se lišily mezi jednotlivými sukcesními stádii a zároveň mezi vrchní (0-5 cm) a minerální (10-15 cm) vrstvou. Počáteční a rané stádium byly bohaté na aktinobakterie, v prostředním převažovaly Gram negativní bakterie a houby; pozdní stádium bylo charakteristické vývojem microeukaryot. Funkční diverzita byla nejvýraznější mezi pozdní fází sukcese a mladšími stádii. Pro společenstvo pozdního stádia bylo charakteristické zvýšené využívání uhlovodíků, na rozdíl od mladších stádií (rané a prostřední), kde byly preferované aminokyseli...

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EH - Ecology - communities

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GA526%2F03%2F1259" target="_blank" >GA526/03/1259: Soil microbial and community structure in spontaneous primary succession on colliery spoil heaps: DNA-, PLFA-, Biolog Systém- analyses</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Phytopedon (Bratislava)

ISSN

1336-1120

e-ISSN

—

Volume of the periodical

3

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

SK - SLOVAKIA

Number of pages

5

Pages from-to

35-39

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—