Amoebae of the genera Vannella Bovee, 1965 and Platyamoeba Page, 1969 isolated from fish and their phylogeny inferred from SSU rRNA gene and ITS sequences

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077409%3A_____%2F05%3A00023692" target="_blank" >RIV/60077409:_____/05:00023692 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60076658:12310/05:00006334

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Amoebae of the genera Vannella Bovee, 1965 and Platyamoeba Page, 1969 isolated from fish and their phylogeny inferred from SSU rRNA gene and ITS sequences

Original language description

Twenty strains of flattened amoebae including 17 isolated from fish were characterised morphologically both at light microscopical and ultrastructural levels and assigned to either the genus Vannella Bovee, 1965 or Platyamoeba Page, 1969. A sequence-based phylogenetic analyses of SSU rRNA genes from a data set representing a total of 29 strains of flattened amoebae strongly indicated that morphological features discriminating both genera do not reflect phylogenetic relationships of representative strains. Contrary to a previous study, strains of this expanded assemblage clustered regardless of their origin. Monophyletic groups were mixed and contained freshwater as well as marine strains of both genera isolated in geographically distant localities of various continents. These findings were supported by results of phylogenetic analyses of selected strains based on ITS sequences. However, topologies of acquired trees were not congruent with results inferred from SSU rRNA analyses.

Czech name

Améby rodů Vannella Bovee, 1965 a Platyamoeba Page, 1969 izolované z ryb a jejich fylogeneze odvozená ze sekvencí SSU rRNA genů a ITS oblastí

Czech description

Dvacet kmenů plochých améb včetně 17 izolovaných z ryb bylo charakterizováno morfologicky na úrovni světelné mikroskopie i ultrastruktury a zařazeno do rodu Vannella Bovee, 1965 nebo do rodu Platyamoeba Page, 1969. Fylogenetické analýzy založené na sekvencích SSU rRNA genů u souboru 29 kmenů plochých améb jasně ukázaly, že morfologické znaky odlišující tyto rody neodrážejí fylogenetické vztahy mezi zastoupenými kmeny. Na rozdíl od předchozí studie, dané kmeny vytvořily skupiny, které neodpovídaly jejichpůvodu z přírodního prostředí. Monofyletické skupiny byly smíšeného původu a zahrnovaly sladkovodní i mořské kmeny obou rodů izolované v geograficky vzdálených lokalitách různých kontinentů. Tato zjištění byla podpořena výsledky fylogenetických analýz založených na ITS sekvencích vybraných kmenů. Topologie ITS stromů však nebyla shodná s výsledky získanými z SSU rRNA analýz.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EA - Morphology and cytology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/IAA6022202" target="_blank" >IAA6022202: Morphological and molecular identification of free-living amoebae infecting fishes</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

European Journal of Protistology

ISSN

0932-4739

e-ISSN

—

Volume of the periodical

41

Issue of the periodical within the volume

3

Country of publishing house

DE - GERMANY

Number of pages

12

Pages from-to

219-230

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—