Mosaic origin of the heme biosynthesis pathway in photosynthetic eukaryotes

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077409%3A_____%2F05%3A00025524" target="_blank" >RIV/60077409:_____/05:00025524 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Mosaic origin of the heme biosynthesis pathway in photosynthetic eukaryotes

Original language description

Heme biosynthesis is one of the most essential metabolic pathways. We have compared the heme pathway in diatoms and red algae to those of plants and heterotrophic eukaryotes. Phylogenetic analyses showed the mosaic character of this pathway in photosynthetic eukaryotes. Although most of the algal and plant enzymes showed the expected plastid origin, at least porphobilinogen deaminase appears to have a mitochondrial origin. Another enzyme, glutamyl-tRNA synthase, originated in eukaryotic nucleus. All theplastid-targeted sequences consistently form a common cluster, which suggests that genes were transferred from the primary endosymbiont to the primary host nucleus shortly after the primary endosymbiotic event, or were replaced with genes from other sources. The one striking exception to this pattern is ferrochelatase. In this case, two red algal sequences do not cluster either with the other plastid or cyanobacterial sequences, and appears to have a proteobacterial origin.

Czech name

Mozaikový původ metabolické dráhy pro syntézu hemu u fotosyntetických eukaryot

Czech description

Syntéza hemu představuje jednu z esenciálních metabolických drah živých organismů. Porovnali jsme syntézu hemu u rozsivek, červených a zelených řas, rostlin a heterotrofních eukaryot. Fylogenetická analýza ukázala, že tato dráha je u všech fotosyntetických eukaryot mozaiková. Ačkoli většina enzymů z červených řas a rostlin ukázala původ plastidech, nejméně jeden enzym (porphobilinogen deamináza) je mitochondriálního původu. Další (glutamyl-tRNA syntáza) pak pochází z eukaryotického jádra. Protože sekvence cílené do plastidů vytvářejí jednotný klastr, byly tyto geny přeneseny z primárního endosymbionta do jádra primárního hostitele krátce po primární endosymbióze, nebo byly vyměněny za geny z jiných zdrojů. Jedinou výjimkou z tohoto schématu je ferochelatáza. V tomto případě totiž nejsou geny z červených řas příbuzné genům z ostatních plastidů, ale jsou pravděpodobně proteobakteriálního původu.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/IAA500220502" target="_blank" >IAA500220502: Evolution of metabolic pathways in complex plastid of the diatom Thalassiosira pseudonana</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Molecular Biology and Evolution

ISSN

0737-4038

e-ISSN

—

Volume of the periodical

22

Issue of the periodical within the volume

12

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

11

Pages from-to

2343-2353

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—