Phylogenetic analysis of freshwater fish trypanosomes from Europe using ssu rRNA gene sequences and random amplification of polymorphic DNA

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077409%3A_____%2F05%3A00025690" target="_blank" >RIV/60077409:_____/05:00025690 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Phylogenetic analysis of freshwater fish trypanosomes from Europe using ssu rRNA gene sequences and random amplification of polymorphic DNA

Original language description

A collection of 22 cloned trypanosome isolates from 14 species of European freshwater fish and 1 species of African freshwater fish were examined by phylogenetic analysis. SSU rRNA genes of 8 isolates were sequenced and compared with sequences from a wide selection of vertebrate trypanosome isolates. All freshwater isolates fell in a single clade, subdivided into 3 groups. This clade sits within a robust clade of trypanosomes from marine fish, amphibia, reptiles and the duck-billed platypus. All 22 trypanosome clones were analysed by RAPD. The resulting tree shows 3 groups congruent with the groups identified in the ssu rRNA gene phylogeny. Two of these groups contain the majority of isolates. These groups do not separate trypanosome species distinguished by morphology or host origin, and thus these criteria do not appear to be reliable guides to genetic relationships among fish trypanosomes. The two groups themselves may represent different species of fish trypanosomes.

Czech name

Fylogenetická analýza trypanosom sladkovodních ryb Evropy využívající sekvence ssu rRNA genu a polymorfismus náhodně amplifikované DNA

Czech description

Molekulárně fylogenetickými metodami bylo analyzováno 22 klonů trypanosom izolovaných ze 14 druhů sladkovodních ryb. SSU rRNA geny 8 klonů byly sekvenovány a porovnány se sekvencemi ssu rRNA genů trypanosom širšího souboru obratlovců. Všechny trypanosomyze sladkovodních ryb spadly do jednoho kladu rozděleného na 3 skupiny. Tento klad je součástí většího robustního kladu obsahujícího trypanosomy mořských ryb a různých obojživelníků. Všech 22 klonů trypanosom bylo analyzováno metodou RAPD. Výsledný dendrogram ukazuje 3 skupiny, které jsou shodné se skupinami identifikovanými ve fylogenezi ssu rRNA genu. Dvě skupiny obsahují většinu izolátů trypanosom, rozdíly uvnitř skupin jsou jen malé. Tyto skupiny neoddělují druhy trypanosom rozlišené podle morfologie nebo původu hostitele. Použitá kritéria tedy nejsou spolehlivými vodítky pro zjišťování genetické příbuznosti rybích trypanosom. Výsledky práce naznačují, že 2 skupiny samy o sobě mohou představovat rozdílné druhy trypanosom ryb.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EA - Morphology and cytology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Parasitology

ISSN

0031-1820

e-ISSN

—

Volume of the periodical

130

Issue of the periodical within the volume

4

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

8

Pages from-to

405-412

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—