GENOTYPING OF SELECTED POTATO CULTIVARS BASED ON STRUCTURAL VARIATION OF TELOMERE-ASSOCIATED CHROMOSOME REGIONS

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F07%3A%230000079" target="_blank" >RIV/60109807:_____/07:#0000079 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

GENOTYPING OF SELECTED POTATO CULTIVARS BASED ON STRUCTURAL VARIATION OF TELOMERE-ASSOCIATED CHROMOSOME REGIONS

Original language description

Molecular genotyping techniques are of still increasing importance in agriculture practice and trade. Here we summarize results of research projects in which a novel assay for genotyping of potato cultivars was established. The assay is based on PCR using combinations of primers derived from telomeric and telomere-associated sequences. A high degree of sequence polymorphism and, namely, the variability in mutual arrangement of otherwise conserved sequence-building-blocks of subtelomeres, enabled us to establish a simple and reliable PCR-based assay to distinguish potato cultivars in 2-3 PCR reactions.

Czech name

GENOTYPIZACE VYBRANÝCH ODRŮD BRAMBORU ZALOŽENÁ NA NA STRUKTURÁLNÍ VARIABILITĚ TELOMER ASOCIOVANÝCH OBLASTÍ CHROMOZOMU

Czech description

Molekulární techniky zvyšují svoji důležitost v zemědělské praxi i v obchodních vztazích. Sumarizujeme zde výsledky výzkumných projektů, jejichž výsledkem je nový přístup k odlišení genotypů odrůd bramboru. Tato metoda je založena na PCR využívající kombinace primerů navržené v oblasti telomer a telomer asociovaných sekvencí. Vysoký stupeň polymorfismu v těchto oblastech a variabilita v uspořádání konzervativních bloků sekvencí v oblasti subtelomer umožňuje zavedení dostupného a spolehlivého postupu využívajícího PCR, který umožňuje u rozlišení odrůd bramboru ve 2 až 3 PCR reakcích.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Sborník příspěvků ze semináře s mezinárodní účastí ?Molekulární a technologické základy produkce kvlitních brambor?, Havlíčkův Brod 19.10. 2007. Vědecké práce ? Výzkumný ústav bramborářský Havlíčkův Brod, 15

ISSN

1802-940X

e-ISSN

—

Volume of the periodical

15

Issue of the periodical within the volume

2007

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

6

Pages from-to

43-48

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—