The use of molecular techniques RT-PCR and QRT-PCR for the detection and identification of Potato Leafroll Virus (PLRV) isolates

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F09%3A0R000619" target="_blank" >RIV/60109807:_____/09:0R000619 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60109807:_____/09:#0000130

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Detekce a identifikace izolátů viru svinutky bramboru (PLRV) pomocí molekulárních technik RT-PCR a QRT-PCR

Original language description

U 55 sbírkových izolátů tohoto viru byly ověřeny možnosti jeho detekce v postupech RT-PCR a QRT-PCR. Pro vlastní zkoušení byly používány jak metody izolace celkové nukleové kyseliny (NA), tak imunovazebné techniky (IC). U RT-PCR byly získány optimální výsledky pomocí primerů dle Solimana, kterými byly detekovány všechny zkoušené izoláty. Pro detekci PLRV metodou Q-RT-PCR byly na základě sekvenční analýzy vlastního izolátu (uvedeno v Gene bank) navrženy tři sady primerů a sondy TaqMan. K vizualizaci amplifikátů virové NA v postupech dvoukrokové Q-RT-PCR bylo používáno jak nespecifické značení pomocí SYBR Green, tak vlastní specifické TaqMan sondy. Uspokojivé výsledky detekce byly dosaženy se všemi sadami primerů, nejlepší výsledky dávala sada primerů L3(SYBR Green) a L2 (TaqMan sonda). Detekce PLRV pomocí QRT-PCR byla možná a spolehlivá při obou postupech značení DNA. Dosažené výsledky byly z hlediska citlivosti a spolehlivosti porovnány s metodou ELISA.

Czech name

Detekce a identifikace izolátů viru svinutky bramboru (PLRV) pomocí molekulárních technik RT-PCR a QRT-PCR

Czech description

U 55 sbírkových izolátů tohoto viru byly ověřeny možnosti jeho detekce v postupech RT-PCR a QRT-PCR. Pro vlastní zkoušení byly používány jak metody izolace celkové nukleové kyseliny (NA), tak imunovazebné techniky (IC). U RT-PCR byly získány optimální výsledky pomocí primerů dle Solimana, kterými byly detekovány všechny zkoušené izoláty. Pro detekci PLRV metodou Q-RT-PCR byly na základě sekvenční analýzy vlastního izolátu (uvedeno v Gene bank) navrženy tři sady primerů a sondy TaqMan. K vizualizaci amplifikátů virové NA v postupech dvoukrokové Q-RT-PCR bylo používáno jak nespecifické značení pomocí SYBR Green, tak vlastní specifické TaqMan sondy. Uspokojivé výsledky detekce byly dosaženy se všemi sadami primerů, nejlepší výsledky dávala sada primerů L3(SYBR Green) a L2 (TaqMan sonda). Detekce PLRV pomocí QRT-PCR byla možná a spolehlivá při obou postupech značení DNA. Dosažené výsledky byly z hlediska citlivosti a spolehlivosti porovnány s metodou ELISA.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

GF - Diseases, pests, weeds and plant protection

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/QH71123" target="_blank" >QH71123: Variability of Potato leafroll luteovirus (PLRV), improved reliability of its detection and utilization of transgenic resistance.</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2009

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Vědecké práce - Výzkumný ústav bramborářský havlíčkův Brod

ISSN

1802-940X

e-ISSN

—

Volume of the periodical

17

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

11

Pages from-to

—

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—