Alternative methods and procedures for Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus diagnosis
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F15%3A%230000333" target="_blank" >RIV/60109807:_____/15:#0000333 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Alternativní metody a postupy laboratorní diagnózy Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus.
Original language description
Práce přináší podrobný popis čtyř metod laboratorní diagnózy Cms, které doplňují stávající postupy a metody doporučené pro skreeningovou kontrolu tohoto patogena. Jsou zahrnuty postupy extrakce jak z hlíz, tak rostlin bramboru a izolace DNA pomocí preparačních kolonek. Z vlastních diagnostických metod jsou detailně uvedeny optimalizované postupy pro DAS ELISA (dva původy protilátek) a postup detekce pomocí technologie Luminex xMAP. Z molekulárních metod jsou detailně popsány postupy práce s komerční soupravou pro konvenční PCR a dva postupy qPCR. Spolehlivost detekce pomocí všech postupů jednotlivě a při jejich srovnání je demonstrována na záznamech výsledků u souboru zdravých a infikovaných vzorků, souběžně diagnostikovaných standardní imunofluorescenční (IF) metodou. Nejvyšší citlivost (řádově až do ředění extraktů 103 ) byla prokázána u metody qPCR, doplněné kontrolou kvality izolované DNA interním markerem. Doporučujeme výběrové využití metod jak pro doplnění oficiální skreeningové kontroly sadbových materiálů, tak pro diagnostické laboratoře šlechtitelských a množitelských organizací disponující nezbytným vybavením.
Czech name
Alternativní metody a postupy laboratorní diagnózy Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus.
Czech description
Práce přináší podrobný popis čtyř metod laboratorní diagnózy Cms, které doplňují stávající postupy a metody doporučené pro skreeningovou kontrolu tohoto patogena. Jsou zahrnuty postupy extrakce jak z hlíz, tak rostlin bramboru a izolace DNA pomocí preparačních kolonek. Z vlastních diagnostických metod jsou detailně uvedeny optimalizované postupy pro DAS ELISA (dva původy protilátek) a postup detekce pomocí technologie Luminex xMAP. Z molekulárních metod jsou detailně popsány postupy práce s komerční soupravou pro konvenční PCR a dva postupy qPCR. Spolehlivost detekce pomocí všech postupů jednotlivě a při jejich srovnání je demonstrována na záznamech výsledků u souboru zdravých a infikovaných vzorků, souběžně diagnostikovaných standardní imunofluorescenční (IF) metodou. Nejvyšší citlivost (řádově až do ředění extraktů 103 ) byla prokázána u metody qPCR, doplněné kontrolou kvality izolované DNA interním markerem. Doporučujeme výběrové využití metod jak pro doplnění oficiální skreeningové kontroly sadbových materiálů, tak pro diagnostické laboratoře šlechtitelských a množitelských organizací disponující nezbytným vybavením.
Classification
Type
N<sub>metC</sub> - Methodology certified by the authorised body
CEP classification
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
—
Continuities
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2015
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
ISBN 978-80-86940-68-7
Regulation ID
6700/2016-MZe-17221
Technical parameters
Smlouva o uplatnění certifikované metodiky. Uživatel: Vesa Velhartice, a.s., IČ:46884335, 31.12.2015. Ing. Viktor Kopačka, Vesa Velhartice a.s. 34142 Velhartice, tel.: +420 602186423
Economical parameters
Zvýšení spolehlivosti diagnózy závažného karanténího onemocnění s nulovou tolerancí výskytu.
Certification body designation
Ministerstvo zemědělství ČR
Date of certification
—
Method of use
C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů