The identification of PVY isolates by means immunocapture RT-PCR probing

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F18%3AN0000020" target="_blank" >RIV/60109807:_____/18:N0000020 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Identifikace PVY izolátů testováním pomocí imunovazebné RT-PCR

Original language description

Bylo charakterizováno dvacet izolátů PVY. Biologicky byly charakterizovány jako PVYO (tři izoláty) a PVYN (17 izolátů). Sérologické a molekulární genetické metody však vedly ke komplikovanějším charakterizacím. Například pět izolátů indukovalo nekrotické příznaky na rostlinách tabáku typických pro PVYN, a to navzdory tomu, že reagovaly sérologicky jako PVYO. Navíc izoláty PVY nebyly podle molekulárních genetických postupů totožné. Typické produkty PVYNTN PCR byly pozorovány u 14 izolátů, ale pět z nich (Hr220-5, Hr387-7, Nord 242, Syn1Scot a 41-97) nevyvolalo nekrotické příznaky bramborových hlíz u infikovaných kultivarů. Metoda imuno-vazebného RT-PCR sondování byla vyvinuta za použití sady 24 párů primerů odvozených z osmi oblastí genomu PVY. Použitím této metody bylo zjištěno, že pět ze sedmi izolátů PVYNTN, včetně českého standardu PVYNTN z odrůdy Nicola, bylo identických. Nicméně dva izoláty PVYNTN a všechny ostatní vzorky PVY ukázaly unikátní vzhled, což naznačuje specifické rozdíly na úrovni nukleotidů. Tato metoda umožnila specifickou identifikaci variability jednotlivých izolátů i v rámci různých podskupin PVY.

Czech name

Identifikace PVY izolátů testováním pomocí imunovazebné RT-PCR

Czech description

Bylo charakterizováno dvacet izolátů PVY. Biologicky byly charakterizovány jako PVYO (tři izoláty) a PVYN (17 izolátů). Sérologické a molekulární genetické metody však vedly ke komplikovanějším charakterizacím. Například pět izolátů indukovalo nekrotické příznaky na rostlinách tabáku typických pro PVYN, a to navzdory tomu, že reagovaly sérologicky jako PVYO. Navíc izoláty PVY nebyly podle molekulárních genetických postupů totožné. Typické produkty PVYNTN PCR byly pozorovány u 14 izolátů, ale pět z nich (Hr220-5, Hr387-7, Nord 242, Syn1Scot a 41-97) nevyvolalo nekrotické příznaky bramborových hlíz u infikovaných kultivarů. Metoda imuno-vazebného RT-PCR sondování byla vyvinuta za použití sady 24 párů primerů odvozených z osmi oblastí genomu PVY. Použitím této metody bylo zjištěno, že pět ze sedmi izolátů PVYNTN, včetně českého standardu PVYNTN z odrůdy Nicola, bylo identických. Nicméně dva izoláty PVYNTN a všechny ostatní vzorky PVY ukázaly unikátní vzhled, což naznačuje specifické rozdíly na úrovni nukleotidů. Tato metoda umožnila specifickou identifikaci variability jednotlivých izolátů i v rámci různých podskupin PVY.

Type

J_ost - Miscellaneous article in a specialist periodical

CEP classification

—

OECD FORD branch

40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Project

—

Continuities

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Publication year

2018

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Vědecké práce VÚB Havlíčkův Brod

ISSN

1802-940X

e-ISSN

—

Volume of the periodical

24

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

8

Pages from-to

45-52

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—