Optimization of FISH analysis for the identification and quantification of bacteria in activated sludge
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22320%2F14%3A43897091" target="_blank" >RIV/60461373:22320/14:43897091 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Optimalizace postupu analýzy FISH pro identifikaci a kvantifikaci bakterií v aktivovaném kalu
Original language description
Fluorescenční in situ hybridizace (FISH) je metoda molekulární biologie, která je využívána pro detekci bakterií (říše, rod, druh) v aktivovaném kalu na základě znalosti specifických sekvencí v jejich nukleových kyselinách, s využitím fluorescenčně označených genových sond. Prvním a zásadním krokem celé analýzy je fixace vzorků. Existuje několik různých postupů pro fixaci vzorků, proto je první část tohoto experimentu zaměřena na nalezení metody optimální. Jako optimální postup fixace byl vyhodnocen postup, při kterém bylo detekováno nejvyšší procento cílových bakterií v jednom vzorku aktivovaného kalu. Vliv použité sušiny aktivovaného kalu na výsledky kvantifikace byl sledován v další části experimentu. Cílem bylo vyzkoušet, zda použitá sušina ovlivňuje hodnoty získané kvantifikací a zda jsou výsledky dvou vzorků s různou sušinou porovnatelné. Bylo tedy zjištěno, zda je potřeba sušinu kalu před analýzou upravovat, či nikoliv. Posledním diskutabilním krokem analýzy FISH je její konečná
Czech name
Optimalizace postupu analýzy FISH pro identifikaci a kvantifikaci bakterií v aktivovaném kalu
Czech description
Fluorescenční in situ hybridizace (FISH) je metoda molekulární biologie, která je využívána pro detekci bakterií (říše, rod, druh) v aktivovaném kalu na základě znalosti specifických sekvencí v jejich nukleových kyselinách, s využitím fluorescenčně označených genových sond. Prvním a zásadním krokem celé analýzy je fixace vzorků. Existuje několik různých postupů pro fixaci vzorků, proto je první část tohoto experimentu zaměřena na nalezení metody optimální. Jako optimální postup fixace byl vyhodnocen postup, při kterém bylo detekováno nejvyšší procento cílových bakterií v jednom vzorku aktivovaného kalu. Vliv použité sušiny aktivovaného kalu na výsledky kvantifikace byl sledován v další části experimentu. Cílem bylo vyzkoušet, zda použitá sušina ovlivňuje hodnoty získané kvantifikací a zda jsou výsledky dvou vzorků s různou sušinou porovnatelné. Bylo tedy zjištěno, zda je potřeba sušinu kalu před analýzou upravovat, či nikoliv. Posledním diskutabilním krokem analýzy FISH je její konečná
Classification
Type
D - Article in proceedings
CEP classification
DJ - Pollution and water control
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/FR-TI4%2F254" target="_blank" >FR-TI4/254: Development of a packaged technology for treatment of industrial wastewater</a><br>
Continuities
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Others
Publication year
2014
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Article name in the collection
Vodárenská biologie 2014
ISBN
978-80-86832-78-4
ISSN
—
e-ISSN
—
Number of pages
6
Pages from-to
114-119
Publisher name
Vodní zdroje Ekomonitor s.r.o.
Place of publication
Chrudim
Event location
Praha
Event date
Feb 5, 2014
Type of event by nationality
CST - Celostátní akce
UT code for WoS article
—