Application of modern methods for the determination of antibiotic resistance
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22330%2F23%3A43926417" target="_blank" >RIV/60461373:22330/23:43926417 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="http://www.chemicke-listy.cz/ojs3/index.php/chemicke-listy/article/view/4263" target="_blank" >http://www.chemicke-listy.cz/ojs3/index.php/chemicke-listy/article/view/4263</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.54779/chl20230358" target="_blank" >10.54779/chl20230358</a>
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Využití moderních metod pro stanovení rezistence k antibiotikům
Original language description
Zvyšující se výskyt antibiotických rezistencí patří k závažným problémům 21. století. Výskyt bakteriálních kmenůrezistentních k antibiotikům následně zužuje spektrum vhodných antibiotik použitelných pro léčbu i běžných bakteriálníchinfekcí nebo pro prevenci jejich výskytu, např. v chirurgii. Čistírny odpadních vod, nemocnice, ale i potravinový řetězecpatří k ohniskům, kde nejčastěji dochází ke vzniku či šíření nových i stávajících kmenů bakterií rezistentníchk antibiotikům a genů rezistence k antibiotikům.Ke stanovení antibiotických rezistencí se v laboratořích standardně používají fenotypové kultivační metody, které jsouvšak náročné na čas i práci a částečně i přesnou interpretaci výsledků. Z tohoto důvodu jsou hledány rychlejší alternativnímetody detekce bakterií rezistentních k antibiotikům nebo přímo genů rezistence k antibiotikům. Příkladem alternativnímetody detekce bakterií rezistentních k antibiotikům je například použití fenotypové metody využívající hmotnostníspektrometrie s laserovou desorpcí a ionizací za účasti matrice s průletovým analyzátorem pro stanovení producentůbeta-laktamas. Zrychlení a zároveň větší přesnost detekce poskytují genotypové metody. Pomocí polymerasové řetězovéreakce lze přímo detekovat a kvantifikovat geny rezistence k antibiotikům. Pro další zrychlení a vyšší specifitu detekceamplikonů z PCR lze použít mikročipy.Metody masivního paralelního sekvenování poskytují ucelenou informaci o rezistomu daného prostředí. Umožňujísekvenovat DNA amplikony či jednotlivé molekuly DNA pro detekci determinant antibiotické rezistence. Metody masivníhoparalelního sekvenování mají potenciál nahradit konvenční charakterizaci patogenů a umožňují detekci všech mikroorganismůve vzorku (včetně obtížně kultivovatelných či nekultivovatelných mikroorganismů).
Czech name
Využití moderních metod pro stanovení rezistence k antibiotikům
Czech description
Zvyšující se výskyt antibiotických rezistencí patří k závažným problémům 21. století. Výskyt bakteriálních kmenůrezistentních k antibiotikům následně zužuje spektrum vhodných antibiotik použitelných pro léčbu i běžných bakteriálníchinfekcí nebo pro prevenci jejich výskytu, např. v chirurgii. Čistírny odpadních vod, nemocnice, ale i potravinový řetězecpatří k ohniskům, kde nejčastěji dochází ke vzniku či šíření nových i stávajících kmenů bakterií rezistentníchk antibiotikům a genů rezistence k antibiotikům.Ke stanovení antibiotických rezistencí se v laboratořích standardně používají fenotypové kultivační metody, které jsouvšak náročné na čas i práci a částečně i přesnou interpretaci výsledků. Z tohoto důvodu jsou hledány rychlejší alternativnímetody detekce bakterií rezistentních k antibiotikům nebo přímo genů rezistence k antibiotikům. Příkladem alternativnímetody detekce bakterií rezistentních k antibiotikům je například použití fenotypové metody využívající hmotnostníspektrometrie s laserovou desorpcí a ionizací za účasti matrice s průletovým analyzátorem pro stanovení producentůbeta-laktamas. Zrychlení a zároveň větší přesnost detekce poskytují genotypové metody. Pomocí polymerasové řetězovéreakce lze přímo detekovat a kvantifikovat geny rezistence k antibiotikům. Pro další zrychlení a vyšší specifitu detekceamplikonů z PCR lze použít mikročipy.Metody masivního paralelního sekvenování poskytují ucelenou informaci o rezistomu daného prostředí. Umožňujísekvenovat DNA amplikony či jednotlivé molekuly DNA pro detekci determinant antibiotické rezistence. Metody masivníhoparalelního sekvenování mají potenciál nahradit konvenční charakterizaci patogenů a umožňují detekci všech mikroorganismůve vzorku (včetně obtížně kultivovatelných či nekultivovatelných mikroorganismů).
Classification
Type
J<sub>SC</sub> - Article in a specialist periodical, which is included in the SCOPUS database
CEP classification
—
OECD FORD branch
10606 - Microbiology
Result continuities
Project
—
Continuities
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Others
Publication year
2023
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Chemické listy
ISSN
0009-2770
e-ISSN
1213-7103
Volume of the periodical
117
Issue of the periodical within the volume
6
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
7
Pages from-to
358-364
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
2-s2.0-85162972333