Determination of molecular structure in solution using vibrational circular dichroism spectroscopy: The supramolecular tetramer of S-2,2'-dimethyl-6,6'-dicarboxylic acid

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22340%2F05%3A00014764" target="_blank" >RIV/60461373:22340/05:00014764 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Determination of molecular structure in solution using vibrational circular dichroism spectroscopy: The supramolecular tetramer of S-2,2'-dimethyl-6,6'-dicarboxylic acid

Original language description

The Infrared (IR) and Vibrational Circular Dichroism (VCD) spectra of S-2,2'-dimethyl-biphenyl-6,6'-dicarboxylic acid, S-1, in CDCl3 solution are concentration-dependent, showing that oligomerization occurs with increasing concentration. DFT calculationssupport the conclusion that the oligomer formed is the cyclic tetramer (S-1)4, in which S-1 monomers are linked by hydrogen(H)-bonded (COOH)2 moieties. Due to the existence of two inequivalent tautomeric conformations of each (COOH)2 moiety, six inequivalent conformations of (S-1)4 are possible. B3LYP/6-31G* DFT calculations predict that the conformation "aaab", possessing three equivalent (COOH)2 conformations, a, and one tautomeric conformation, b, has the lowest free energy. B3LYP/6-31G* IR and VCDspectra vary substantially with conformation. The B3LYP/6-31G* IR and VCD spectra of the C=O stretch modes of "aaab" are in excellent agreement with the experimental spectra, while those of all other conformations exhi

Czech name

Určení molekulární struktury v roztoku pomocí spektroskopie vibračního cirkulárního dichroismu: supramolekulární tetramér S-2,2´-dimetyl-bifenyl-6,6'- dikarboxylové kyseliny

Czech description

Infračervená (IČ) spektra a spektra vibračního cirkulárního dichroismu (VCD) S-2,2'-dimethyl-biphenyl-6,6'-dikarboxylové kyseliny, S-1, v CDCl3 jsou závislá na koncentraci a ukazují, že dochází k oligomerizaci se vrůstající koncentrací. Výpočet metodou DFT podporuje závěr, že vniklý oligonukleotid je cyklický tetramér (S-1)4,, v němž monomery S-1 jsou vázány vodíkovou vazbou prostřednictvím skupin (COOH)2. Protože (COOH)2 existuje ve dvou tautomerních formách, existuje 6 neekvivalentních konformací tetraméru (S-1)4. Výpočet metodou B3LYP/6-31G* DFT předpovídá, že konformace "aaab" mající tří ekvivalentní konformace a skupiny (COOH) a jednu tautomerní konformaci b má nejnižší volnou energii. Spektra IČ a VCD získaná metodou B3LYP/6-31G* IR se podstaně liší pro jednotlivé konformace. IČ a VCD spektra získaná metodou B3LYP/6-31G* v oblasti valenční vibrace C=O konformace "aaab" se výborně shodují s experimentálními spektry, zatímco jiné konformace nevykazují sho

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

CB - Analytical chemistry, separation

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Journal American Chem.Society

ISSN

0002-7863

e-ISSN

—

Volume of the periodical

127

Issue of the periodical within the volume

18

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

12

Pages from-to

6700-6711

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—