Handling electrostatic interactions in molecular simulations: A systematic study

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22340%2F08%3A00020667" target="_blank" >RIV/60461373:22340/08:00020667 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/44555601:13440/08:00004175 RIV/67985858:_____/08:00312765

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Handling electrostatic interactions in molecular simulations: A systematic study

Original language description

Two qualitatively different models with strong long-range electrostatic interactions, Lennard­Jones diatomics with an embedded dipole moment and TIP4P/2005 water, are considered in extensive Monte Carlo and molecular dynamics simulations to systematically study the differences in results caused by different treatments of the long-range electrostatic interactions. In addition to the standard Ewald summation and reaction field methods, we consider also two variants of short-range approximations. Both thermodynamic and structural properties, and both homogeneous and inhomogeneous phases are considered. It is shown that the accuracy of the short-range approximations with carefully selected parameters may be sufficient for a number of applications; however,in some cases one can encounter accuracy limits or structural or other artifacts.

Czech name

Jak na elektrostatické interakce v molekulárních simulacích: systematická studie

Czech description

V extenzivních Monte Carlo a molekulárně-dynamických simulacích uvažujeme dva kvalitativně odlišné modely se silnými dlouhodosahovými elektrostatickými interakcemi, Lennard-Jonesovu dvojatomovou molekulu s dipólovým momentem a TIP4P/2005 vodu, abychom systematicky prostudovali různé implementace dlouhodosahových elektrostatických sil. Kromě standardní Ewaldovy sumace a metody reakčního pole studujeme dvě varianty krátkodosahových interakcí. Uvažujeme jak termodynamické tak i strukturní vlastnosti a homogenní i nehomogenní fáze. Ukazujeme, že přesnost krátkodoshových aproximací může být při pečlivém nastavení parametrů dostatečná pro řadu aplikací; jindy však narážíme na limity přesnosti nebo na strukturní i jiné artefakty.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

CF - Physical chemistry and theoretical chemistry

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/1ET400720409" target="_blank" >1ET400720409: Applicationof advanced simulation methods for studying the structure, physico-chemical properties, and preparationof composites and nanomaterials</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Collection of Czechoslovak Chemical Communications

ISSN

0010-0765

e-ISSN

—

Volume of the periodical

73

Issue of the periodical within the volume

4

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

26

Pages from-to

—

UT code for WoS article

000256753400003

EID of the result in the Scopus database

—